我们准备了一系列大小不一的非天然核苷酸,它们均基于荧光(dApyrTP,dUpyrTP,dUantTP,dUthiTP)和淬灭(dUazoTP)单元,以及具有小的官能团(dAethTP,dAoctTP,dUethTP,dUiodTP)的核苷酸。脱氧
腺苷和脱氧
尿苷,并检查了它们在酶促掺入和扩展到DNA中的适用性。我们观察到引物延伸过程中掺入和延伸能力的大小依赖性(遵循dUiodTP = dUethTP = dUthiTP> dUazoTP> dUpyrTP> dUantTP的顺序)。该结果得到圆二色性(CD)光谱的支持,圆二色性光谱揭示了不同B型DNA结构的趋势,该结构取决于脱氧
尿苷5位单元的大小(dUiodTP> dUethTP> dUthiTP> dUpyrTP)。从PCR产物。有趣的是,dUthiTP可以在引物延伸甚至PCR扩增过程中掺入并延伸到长DNA链中,CD光谱证实了稳定的二级B