3'-O-(2-cyanoethoxy)(diisopropylamino)phosphino-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-4'-C-(N-(pyren-1-ylcarbonyl)piperazino)methylthymidine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 3'-O-(2-cyanoethoxy)(diisopropylamino)phosphino-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-4'-C-(N-(pyren-1-ylcarbonyl)piperazino)methylthymidine
• 英文别名: 3-[[(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-2-[[4-(pyrene-1-carbonyl)piperazin-1-yl]methyl]oxolan-3-yl]oxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxypropanenitrile
• 化学式: C₆₂H₆₇N₆O₉P
• 分子量: 1071.22
• InChiKey: BDEOIWZDJDBIGK-JEJLCOJRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  9.5
• 重原子数：
  78
• 可旋转键数：
  20
• 环数：
  10.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.35
• 拓扑面积：
  155
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  12

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  1-芘甲酸 在 四丁基氟化铵 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N,N'-羰基二咪唑 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 生成 3'-O-(2-cyanoethoxy)(diisopropylamino)phosphino-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-4'-C-(N-(pyren-1-ylcarbonyl)piperazino)methylthymidine
  参考文献：
  名称：

  DNA-selective hybridization and dual strand invasion of short double-stranded DNA using pyren-1-ylcarbonyl-functionalized 4′-C-piperazinomethyl-DNA

  摘要：

  将新型芘-1-羰基官能化 4â²-C-哌嗪甲基-DNA 单体加入寡聚脱氧核苷酸中，可提高 DNA 互补双链的热稳定性，但降低 RNA 互补双链的热稳定性。这种 DNA 选择性杂交是通过一种新颖的双链入侵方法来识别双链 DNA 的。

  DOI：

  10.1039/b402414a

文献信息

• DNA-selective hybridization and dual strand invasion of short double-stranded DNA using pyren-1-ylcarbonyl-functionalized 4′-C-piperazinomethyl-DNA
  作者：Torsten Bryld、Torben Højland、Jesper Wengel

  DOI：10.1039/b402414a

  日期：——

  Incorporation of a novel pyren-1-ylcarbonyl-functionalized 4′-C-piperazinomethyl-DNA monomer into oligodeoxynucleotides leads to increased thermal stability of duplexes with DNA complements but reduced thermal stability of duplexes with RNA complements. This DNA-selective hybridization is explored for recognition of double-stranded DNA by a novel dual strand invasion approach.

  将新型芘-1-羰基官能化 4â²-C-哌嗪甲基-DNA 单体加入寡聚脱氧核苷酸中，可提高 DNA 互补双链的热稳定性，但降低 RNA 互补双链的热稳定性。这种 DNA 选择性杂交是通过一种新颖的双链入侵方法来识别双链 DNA 的。