5-Trifluoromethyl-4'-(3-carboxypropionyl)-5'-dimethoxytrityl-2'-deoxy-uridine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5-Trifluoromethyl-4'-(3-carboxypropionyl)-5'-dimethoxytrityl-2'-deoxy-uridine
• 英文别名: 4-[(2S,3S,5R)-5-[2,4-dioxo-5-(trifluoromethyl)pyrimidin-1-yl]-3-hydroxy-2-[1-hydroxy-2,2-bis(2-methoxyphenyl)-2-phenylethyl]oxolan-2-yl]-4-oxobutanoic acid
• 化学式: C₃₅H₃₃F₃N₂O₁₀
• 分子量: 698.65
• InChiKey: BIIFCGYEVCBARE-ZFGBUYDYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.6
• 重原子数：
  50
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.31
• 拓扑面积：
  172
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  13

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  diisopropylethyl amine 、 5-Trifluoromethyl-4'-(3-carboxypropionyl)-5'-dimethoxytrityl-2'-deoxy-uridine 、 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 以 N-甲基乙酰胺 为溶剂， 生成 2-氨基-5-(2-脱氧-beta-D-赤式-呋喃戊糖基)-4(1H)-嘧啶酮
  参考文献：
  名称：

  Modified oligonucleotides and applications thereof

  摘要：

  公开的内容包括在引物的3'端区域中含有某些修饰核苷酸的引物，这些修饰核苷酸可以在扩增反应期间减少引物二聚体的形成，并且公开了各种使用方法。

  公开号：

  US20060084079A1

文献信息

• Modified Oligonucleotides and Applications Thereof
  申请人：Mullah Khairuzzaman Bashar

  公开号：US20110144319A1

  公开（公告）日：2011-06-16

  Disclosed, among other things, are primers containing certain modified nucleobases in the 3′ terminal region of the primers that provide reduced formation of primer-dimers during amplification reactions, and various methods of use thereof.

  披露了包含在引物的3'端区域中的某些修饰核苷酸碱基的引物，这些引物在扩增反应过程中减少引物二聚体形成，并且披露了各种使用方法。
• 3'MODIFIED OLIGONUCLEOTIDES CONTAINING PSEUDOISOCYTOSINE NUCLEOBASE DERIVATIVES AND APPLICATIONS THEREOF AS PRIMERS OR PROBES
  申请人：Applied Biosystems, LLC

  公开号：EP1902142B1

  公开（公告）日：2010-01-06
• 3'modified oligonucleotides containing pseudoisocytosine nucleobase derivatives and applications thereof as primers or probes
  申请人：Applied Biosystems, LLC

  公开号：EP2409980B1

  公开（公告）日：2015-06-03
• US7408051B2
  申请人：——

  公开号：US7408051B2

  公开（公告）日：2008-08-05
• US7414118B1
  申请人：——

  公开号：US7414118B1

  公开（公告）日：2008-08-19