2-({4-[(3-{[4-({[2-bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy]ethoxy}methyl)phenyl]ethynyl}phenyl)ethynyl]phenyl}methoxy)ethanol | 803724-04-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 2-({4-[(3-{[4-({[2-bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy]ethoxy}methyl)phenyl]ethynyl}phenyl)ethynyl]phenyl}methoxy)ethanol
• 英文别名: 2-[[4-[2-[3-[2-[4-[2-[Bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]ethoxymethyl]phenyl]ethynyl]phenyl]ethynyl]phenyl]methoxy]ethanol
• CAS: 803724-04-1
• 化学式: C₄₉H₄₄O₆
• 分子量: 728.885
• InChiKey: UPPZLFIOTXHMOB-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  842.5±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.24±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  9
• 重原子数：
  55
• 可旋转键数：
  19
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.18
• 拓扑面积：
  66.4
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-氰乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺 、 2-({4-[(3-{[4-({[2-bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy]ethoxy}methyl)phenyl]ethynyl}phenyl)ethynyl]phenyl}methoxy)ethanol 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 生成 3-[2-[[4-[2-[3-[2-[4-[2-[Bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]ethoxymethyl]phenyl]ethynyl]phenyl]ethynyl]phenyl]methoxy]ethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxypropanenitrile
  参考文献：
  名称：

  Cooperative Melting in Caged Dimers with Only Two DNA Duplexes

  摘要：

  Small molecule DNA hybrids with only two parallel DNA duplexes (rSMDH(2)) displayed sharper melting profiles compared to unmodified DNA duplexes, consistent with predictions from neighboring-duplex theory. Using adjusted thermodynamic parameters obtained from a coarse-grain dynamic simulation, the experimental data fit well to an analytical model.

  DOI：

  10.1021/ja107232x
• 作为产物：
  描述：

  4-碘苄基溴 在 bis-triphenylphosphine-palladium(II) chloride 、 copper(l) iodide 、 sodium hydride 、 三乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 38.58h， 生成 2-({4-[(3-{[4-({[2-bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy]ethoxy}methyl)phenyl]ethynyl}phenyl)ethynyl]phenyl}methoxy)ethanol
  参考文献：
  名称：

  具有高稳定性和特异性的第一个有效连接5'，5'-连接的交替链Hoogsteen三链体的插入式连接子的设计

  摘要：

  这是第一个描述设计，合成和掺入可有效形成5'，5'-连接的交替链Hoogsteen三链体的插入式接头的报告。使用分子建模，以一种非常简单的方式解决了5'，5'问题。两个相对较远的5'-末端已与一个分子连接，该分子为结构提供了刚性，同时又具有足够的柔韧性以允许在所有四根链上堆叠。Sonogashira进行了设计分子核心的合成适当取代的碘苯与1,3-二乙炔基苯偶合，得到共轭体系，其中三个苯环与三键互连。对于用插入连接子获得的交替链三链体，获得的稳定性高于具有相同总长度和相同核苷酸的相应同源三链体的稳定性。这是由交替三元组的熔化温度高5°得出的。交替链三链体对错配的敏感性与同三链体所观察到的范围相同（ΔT m = -13°至-19°）。

  DOI：

  10.1002/hlca.200490220

文献信息

• [EN] INTERCALATING TRIPLEX FORMING OLIGONUCLEOTIDE DERIVATIVES AND PROCESS FOR THE PREPARATION THEREOF<br/>[FR] DERIVES D'OLIGONUCLEOTIDES INTERCALANTS FORMANT UNE STRUCTURE TRIPLEX ET LEUR PROCEDE DE PREPARATION
  申请人：UNIV SYDDANSK

  公开号：WO2005083084A1

  公开（公告）日：2005-09-09

  The present invention relates to novel intercalating oligonucleotide derivatives, which are useful for stabilizing natural or modified DNA and RNA triplexes and hybrids thereof. A linker for alternate strand triplex formation is described. The linker is designed so that it is able to stabilize the triplex by intercalation. The alternate strand triplex shows higher stability than the one of a homotriplex of the same length. The specificity of the alternate strand triplex is in the same range as for a traditional triplex in the case of a single mismatch.