3′-O-[2-cyanoethoxy(diisopropylamino)phosphino]-5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)-N²-(2-((9-fluorenylmethyloxycarbonyl)amino)ethyl) 2′-deoxy-5-methylisocytidine | 1439607-53-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 3′-O-[2-cyanoethoxy(diisopropylamino)phosphino]-5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)-N²-(2-((9-fluorenylmethyloxycarbonyl)amino)ethyl) 2′-deoxy-5-methylisocytidine
• 英文别名: 9H-fluoren-9-ylmethyl N-[2-[[1-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxyoxolan-2-yl]-5-methyl-4-oxopyrimidin-2-yl]amino]ethyl]carbamate
• CAS: 1439607-53-0；1439607-56-3
• 化学式: C₅₇H₆₅N₆O₉P
• 分子量: 1009.15
• InChiKey: KZCRUSAIBGHVRF-PYSKMRHASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.6
• 重原子数：
  73
• 可旋转键数：
  24
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.37
• 拓扑面积：
  165
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  (1R,10R,11S)-11-羟基-4-甲基-8,13-二氧杂-2,6-二氮杂三环[8.2.1.02,7]十三-3,6-二烯-5-酮 在 吡啶 、 sodium carbonate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 6.0h， 生成 3′-O-[2-cyanoethoxy(diisopropylamino)phosphino]-5′-O-(4,4′-dimethoxytrityl)-N²-(2-((9-fluorenylmethyloxycarbonyl)amino)ethyl) 2′-deoxy-5-methylisocytidine
  参考文献：
  名称：

  N-（Guanidinoethyl）-2'-deoxy-5-methylisocytidine显示选择性识别CG中断位点以形成反平行三链体†

  摘要：

  用于形成含嘧啶-嘌呤倒位位点的三链体DNA的新型核苷类似物的开发一直是一个充满挑战的领域。在本文中，我们描述了非天然核苷类似物N-取代的2'-脱氧-5-甲基异胞苷衍生物的设计与合成，以及它们对三链体形成的评估。已经显示出N-（胍基乙基）-2'-脱氧-5-甲基异胞苷显示出对CG中断位点的选择性识别并增强了反平行三链体的形成。

  DOI：

  10.1039/c3ob40472b