(2S,5S)-2-amino-5-[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl]-6-(benzylamino)hexanoic acid | 1431134-93-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 5'-脱氧核糖核苷
• 英文名称: (2S,5S)-2-amino-5-[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl]-6-(benzylamino)hexanoic acid
• CAS: 1431134-93-8
• 化学式: C₂₃H₃₁N₇O₅
• 分子量: 485.543
• InChiKey: JACGAMFTHXTCBV-FMLXRRIPSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.1
• 重原子数：
  35
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.48
• 拓扑面积：
  195
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  (2R,3R,4R,5R)-2-((2S,5S)-2-(aminomethyl)-6-methoxy-6-oxo-5-(2,2,2-trifluoroacetamido)hexyl)-5-(6-benzamido-9H-purin-9-yl)tetrahydrofuran-3,4-diyl diacetate 、 在 lithium hydroxide 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 40.0h， 以6.5 mg的产率得到WZ16
  参考文献：
  名称：

  CARM1的化学探针改变了对抗乳腺癌细胞侵袭的表观遗传可塑性

  摘要：

  CARM1 是一种癌症相关蛋白精氨酸甲基转移酶，可调节转录的许多方面。其药理抑制作用是一种很有前景的抗癌策略。这里 SKI-73（本工作中的 6a）作为具有前药特性的 CARM1 化学探针呈现。SKI-73 (6a) 可以快速穿透细胞膜，然后被加工成活性抑制剂，这些抑制剂以 10 倍的富集保留在细胞内数天。这些化合物的特征在于它们的效力、选择性、作用模式和靶向作用。SKI-73 (6a) 概括了 CARM1 敲除对乳腺癌细胞侵袭的影响。单细胞 RNA-seq 分析显示，SKI-73(6a) 相关的侵袭性降低通过改变表观遗传可塑性和抑制易侵袭亚群来发挥作用。有趣的是，SKI-73 (6a) 和 CARM1 敲除以显着差异改变表观遗传可塑性，表明小分子和遗传扰动的不同作用模式。因此，我们发现了癌症转移的 CARM1 成瘾机制，并开发了一种化学探针来靶向这一过程。

  DOI：

  10.7554/elife.47110

文献信息

• A chemical probe of CARM1 alters epigenetic plasticity against breast cancer cell invasion
  作者：Xiao-Chuan Cai、Tuo Zhang、Eui-jun Kim、Ming Jiang、Ke Wang、Junyi Wang、Shi Chen、Nawei Zhang、Hong Wu、Fengling Li、Carlo C dela Seña、Hong Zeng、Victor Vivcharuk、Xiang Niu、Weihong Zheng、Jonghan P Lee、Yuling Chen、Dalia Barsyte、Magda Szewczyk、Taraneh Hajian、Glorymar Ibáñez、Aiping Dong、Ludmila Dombrovski、Zhenyu Zhang、Haiteng Deng、Jinrong Min、Cheryl H Arrowsmith、Linas Mazutis、Lei Shi、Masoud Vedadi、Peter J Brown、Jenny Xiang、Li-Xuan Qin、Wei Xu、Minkui Luo

  DOI：10.7554/elife.47110

  日期：——

  cancer-relevant protein arginine methyltransferase that regulates many aspects of transcription. Its pharmacological inhibition is a promising anti-cancer strategy. Here SKI-73 (6a in this work) is presented as a CARM1 chemical probe with pro-drug properties. SKI-73 (6a) can rapidly penetrate cell membranes and then be processed into active inhibitors, which are retained intracellularly with 10-fold enrichment

  CARM1 是一种癌症相关蛋白精氨酸甲基转移酶，可调节转录的许多方面。其药理抑制作用是一种很有前景的抗癌策略。这里 SKI-73（本工作中的 6a）作为具有前药特性的 CARM1 化学探针呈现。SKI-73 (6a) 可以快速穿透细胞膜，然后被加工成活性抑制剂，这些抑制剂以 10 倍的富集保留在细胞内数天。这些化合物的特征在于它们的效力、选择性、作用模式和靶向作用。SKI-73 (6a) 概括了 CARM1 敲除对乳腺癌细胞侵袭的影响。单细胞 RNA-seq 分析显示，SKI-73(6a) 相关的侵袭性降低通过改变表观遗传可塑性和抑制易侵袭亚群来发挥作用。有趣的是，SKI-73 (6a) 和 CARM1 敲除以显着差异改变表观遗传可塑性，表明小分子和遗传扰动的不同作用模式。因此，我们发现了癌症转移的 CARM1 成瘾机制，并开发了一种化学探针来靶向这一过程。