methyl 2-((6-chloro-7-cyclopropylthieno[3,2-d]pyrimidin-4-yl)thio)acetate | 1365062-04-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 噻吩并嘧啶酮衍生物
• 英文名称: methyl 2-((6-chloro-7-cyclopropylthieno[3,2-d]pyrimidin-4-yl)thio)acetate
• 英文别名: Methyl 2-(6-chloro-7-cyclopropylthieno[3,2-d]pyrimidin-4-yl)sulfanylacetate
• CAS: 1365062-04-9
• 化学式: C₁₂H₁₁ClN₂O₂S₂
• 分子量: 314.817
• InChiKey: GVJOBEXVPOAADS-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.9
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.42
• 拓扑面积：
  106
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl 2-((6-chloro-7-cyclopropylthieno[3,2-d]pyrimidin-4-yl)thio)acetate 在 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 、 sodium hydroxide 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 1.25h， 生成 2-(6-chloro-7-cyclopropylthieno[3,2-d]pyrimidin-4-yl)sulfanyl-1-(6,8-dihydro-5H-[1,2,4]triazolo[4,3-a]pyrazin-7-yl)ethanone
  参考文献：
  名称：

  使用1-氯-1,2-苯并恶恶唑-3-酮作为高级亲电子氯化剂的Notum抑制剂LP-922056的改进，可扩展合成

  摘要：

  背景：羧酸酯酶Notum已被证明通过介导Wnt蛋白的去棕榈油酰化作用而成为Wnt信号通路的关键负调控因子。LP-922056（1）是Notum的口服活性抑制剂。我们正在研究Notum在调节中枢神经系统中Wnt信号传导中的作用，并希望确定1是否可以作为周围受限的控制。一种易于使用且经过改进的合成途径将使1可以更容易地用作化学工具，以探索Notum的基本生物学并建立靶标验证，以支持新的药物发现计划。

  DOI：

  10.3762/bjoc.15.271
• 作为产物：
  描述：

  7-溴-4-氯噻酚并[3,2-D]嘧啶 在 盐酸 、 bis-triphenylphosphine-palladium(II) chloride 、 potassium phosphate 、 1-氯-1Λ3,2-苯碘酰-3-酮 、 三乙胺 、 三氯氧磷 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲苯 为溶剂， 反应 98.0h， 生成 methyl 2-((6-chloro-7-cyclopropylthieno[3,2-d]pyrimidin-4-yl)thio)acetate
  参考文献：
  名称：

  使用1-氯-1,2-苯并恶恶唑-3-酮作为高级亲电子氯化剂的Notum抑制剂LP-922056的改进，可扩展合成

  摘要：

  背景：羧酸酯酶Notum已被证明通过介导Wnt蛋白的去棕榈油酰化作用而成为Wnt信号通路的关键负调控因子。LP-922056（1）是Notum的口服活性抑制剂。我们正在研究Notum在调节中枢神经系统中Wnt信号传导中的作用，并希望确定1是否可以作为周围受限的控制。一种易于使用且经过改进的合成途径将使1可以更容易地用作化学工具，以探索Notum的基本生物学并建立靶标验证，以支持新的药物发现计划。

  DOI：

  10.3762/bjoc.15.271

文献信息

• Scaffold-hopping identifies furano[2,3-d]pyrimidine amides as potent Notum inhibitors
  作者：Benjamin N. Atkinson、David Steadman、William Mahy、Yuguang Zhao、James Sipthorp、Elliott D. Bayle、Fredrik Svensson、George Papageorgiou、Fiona Jeganathan、Sarah Frew、Amy Monaghan、Magda Bictash、E. Yvonne Jones、Paul V. Fish

  DOI：10.1016/j.bmcl.2019.126751

  日期：2020.2

  The carboxylesterase Notum is a key negative regulator of the Wnt signaling pathway by mediating the depalmitoleoylation of Wnt proteins. Our objective was to discover potent small molecule inhibitors of Notum suitable for exploring the regulation of Wnt signaling in the central nervous system. Scaffold-hopping from thienopyrimidine acids 1 and 2, supported by X-ray structure determination, identified 3-methylimidazolin-4-one amides 20-24 as potent inhibitors of Notum with activity across three orthogonal assay formats (biochemical, extra-cellular, occupancy). A preferred example 24 demonstrated good stability in mouse microsomes and plasma, and cell permeability in the MDCK-MDR1 assay albeit with modest P-gp mediated efflux. Pharmacokinetic studies with 24 were performed in vivo in mouse with single oral administration of 24 showing good plasma exposure and reasonable CNS penetration. We propose that 24 is a new chemical tool suitable for cellular studies to explore the fundamental biology of Notum.
• Stimulation of cortical bone formation with thienopyrimidine based inhibitors of Notum Pectinacetylesterase
  作者：James E. Tarver、Praveen K. Pabba、Joseph Barbosa、Qiang Han、Michael W. Gardyan、Robert Brommage、Andrea Y. Thompson、James M. Schmidt、Alan G.E. Wilson、Wei He、Victoria K. Lombardo、Kenneth G. Carson

  DOI：10.1016/j.bmcl.2016.02.021

  日期：2016.3

  A group of small molecule thienopyrimidine inhibitors of Notum Pectinacetylesterase are described. We explored both 2-((5,6-thieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl)thio)acetic acids and 2-((6,7-thieno[3,2-d]pyrimidin-4-yl)thio)acetic acids. In both series, highly potent, orally active Notum Pectinacetylesterase inhibitors were identified. (C) 2016 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• INHIBITORS OF NOTUM PECTINACETYLESTERASE AND METHODS OF THEIR USE
  申请人：Lexicon Pharmaceuticals, Inc.

  公开号：EP2616471B1

  公开（公告）日：2014-12-31