5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-1-(β-D-ribofuranosyl)-5-(N-trifluoroacetyl)methylaminomethyl-4-pyrimidinone | 1360058-50-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-1-(β-D-ribofuranosyl)-5-(N-trifluoroacetyl)methylaminomethyl-4-pyrimidinone
• CAS: 1360058-50-9
• 化学式: C₄₀H₄₈F₃N₃O₈Si
• 分子量: 783.917
• InChiKey: DVZLFEMCAFNRMX-OXRFBFFUSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.44
• 重原子数：
  55.0
• 可旋转键数：
  13.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.42
• 拓扑面积：
  121.58
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  10.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-5-(N-trifluoroacetyl)methylaminomethyl-2-thiouridine 在 吡啶 、 间氯过氧苯甲酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 4.0h， 以82%的产率得到5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-1-(β-D-ribofuranosyl)-5-(N-trifluoroacetyl)methylaminomethyl-4-pyrimidinone
  参考文献：
  名称：

  5-甲基氨基甲基-2-硫尿苷和2-硫尿苷的位点特异性掺入RNA序列

  摘要：

  我们提出了一种可重复的协议，用于将5-甲基氨基甲基-2-硫尿苷（mnm 5 s 2 U）特异地掺入模型RNA片段中，以及与2-甲基腺苷（m 2 A）一起掺入到其天然序列中大肠杆菌tRNA Glu2反密码子臂（E. coli ASL Glu2）。该方法也用于合成被多个2-硫代尿苷修饰的低聚物。

  DOI：

  10.1016/j.tetlet.2011.12.079