5'-O-levulinyl 2'-O-monomethoxytrityl 3'-O-phosphoramidous ribouridine | 1455429-80-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-levulinyl 2'-O-monomethoxytrityl 3'-O-phosphoramidous ribouridine
• 英文别名: 5′-levulinyl-2'-MMT-ribouridine phosphoramidite
• CAS: 1455429-80-7；1455429-83-0
• 化学式: C₄₃H₅₁N₄O₁₀P
• 分子量: 814.872
• InChiKey: RGTOVGIEPIIFKK-HIQLSECPSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.39
• 重原子数：
  58.0
• 可旋转键数：
  20.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.42
• 拓扑面积：
  171.41
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  13.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  乙酰丙酸 在 吡啶 、 silver nitrate 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 乙醚 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 5'-O-levulinyl 2'-O-monomethoxytrityl 3'-O-phosphoramidous ribouridine
  参考文献：
  名称：

  固相合成和高阶siRNA及其生物缀合物的自组装。

  摘要：

  最近，在开发新的和改良的基因疗法中，合成高阶siRNA基序及其生物缀合物的新方法引起了广泛的关注。我们的努力旨在产生新的化学工具和方案，用于产生修饰的siRNA，以筛选重要的致癌基因靶标，并沉默其在癌症模型中进行有效基因治疗的活性。更具体地说，我们已经开发出了一种有效的溶液相合成方法，用于生产核糖核苷支点合成子，该合成物可以通过固相合成有效地整合到更高阶的RNA结构中，包括采用V型，Y型和>-<型的结构RNA模板。互补RNA与模板链的自组装产生了更高阶的siRNA纳米结构，其特征在于PAGE，DLS，和TEM技术。为了扩展功能多样的siRNA的种类，我们还开发了固相生物缀合策略，以掺入生物活性探针（例如脂肪酸附肢和荧光报告基因）。综上所述，这些方法突出了产生更高阶siRNA及其生物结合物的能力，以探索修饰的siRNA结构对抗癌活性的影响。

  DOI：

  10.1111/cbdd.13448

文献信息

• Solid-phase synthesis, characterization and RNAi activity of branch and hyperbranch siRNAs
  作者：Anthony Maina、Brittany A. Blackman、Christopher J. Parronchi、Eva Morozko、Maria E. Bender、Allan D. Blake、David Sabatino

  DOI：10.1016/j.bmcl.2013.08.033

  日期：2013.10

  Linear, branch and hyperbranch siRNAs were effectively prepared for down-regulating GRP78 expression and inducing cell death in HepG2 liver cancer cells. Branch and hyperbranch GRP78 siRNAs were synthesized by automated solid-phase synthesis in good yields (44–78%) and isolated in excellent purities (>99%) following HPLC purification. Moreover, siRNAs adopted stable intramolecular hybrids as discerned

  有效地制备了线性，分支和超分支siRNA，用于下调GRP78表达并诱导HepG2肝癌细胞中的细胞死亡。分支和超分支GRP78 siRNA通过自动固相合成以高产率（44–78％）合成，并在HPLC纯化后以优异的纯度（> 99％）分离。此外，通过天然PAGE和热变性研究可知，siRNA采用了稳定的分子内杂种。这些序列还表现出触发RNAi活性所必需的A型螺旋轨迹，如CD光谱法所确定的。生物学研究证实，在抑制癌细胞生存能力约20％的同时，有力地抑制了GRP78的表达（50-60％）。因此，在癌症基因治疗应用中，分支和超分支siRNA可以作为有效的siRNA候选物。