O⁶<2-methoxy-6-chloro-9-(ω-pentylamino)>-acridine-5'-O-dimethoxytrityl-N²-acetyldeoxyguanosine | 175400-31-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: O⁶<2-methoxy-6-chloro-9-(ω-pentylamino)>-acridine-5'-O-dimethoxytrityl-N²-acetyldeoxyguanosine
• 英文别名: N-[9-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]-6-[5-[(6-chloro-2-methoxyacridin-9-yl)amino]pentoxy]purin-2-yl]acetamide
• CAS: 175400-31-4
• 化学式: C₅₂H₅₂ClN₇O₈
• 分子量: 938.48
• InChiKey: PETPZQLHQNLWKK-VURFOUDESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  9.48
• 重原子数：
  68.0
• 可旋转键数：
  19.0
• 环数：
  9.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.29
• 拓扑面积：
  173.23
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  14.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-氰乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺 、 O⁶<2-methoxy-6-chloro-9-(ω-pentylamino)>-acridine-5'-O-dimethoxytrityl-N²-acetyldeoxyguanosine 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 0.42h， 以85%的产率得到O⁶-<2-methoxy-6-chloro-9-(ω-pentylamino)>-acridine-5'-O-dimethoxytrityl-3'-O-(2-cyanoethyl N,N-diisopropylamidophosphite)-N²-acetyldeoxyguanosine
  参考文献：
  名称：

  用于三螺旋形成的o 6修饰的含脱氧鸟苷的寡脱氧核糖核苷酸的合成与表征

  摘要：

  已经合成了通过其C-6位连接到补骨脂素和an啶衍生物的两个新的修饰的脱氧鸟苷衍生物，并将其掺入寡核苷酸链中。讨论了在纯化包含一段G的寡核苷酸的过程中观察到的困难以及用于解决此问题的一种方法。

  DOI：

  10.1016/0040-4020(95)01043-2
• 作为产物：
  描述：

  O⁶-(2,4,6-triisopropylbenzenesulfonyl)-5'-O-dimethoxytrityl-3'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-N²-acetyldeoxyguanosine 在 吡啶 、 四丁基氟化铵 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙腈 为溶剂， 反应 73.0h， 生成 O⁶<2-methoxy-6-chloro-9-(ω-pentylamino)>-acridine-5'-O-dimethoxytrityl-N²-acetyldeoxyguanosine
  参考文献：
  名称：

  用于三螺旋形成的o 6修饰的含脱氧鸟苷的寡脱氧核糖核苷酸的合成与表征

  摘要：

  已经合成了通过其C-6位连接到补骨脂素和an啶衍生物的两个新的修饰的脱氧鸟苷衍生物，并将其掺入寡核苷酸链中。讨论了在纯化包含一段G的寡核苷酸的过程中观察到的困难以及用于解决此问题的一种方法。

  DOI：

  10.1016/0040-4020(95)01043-2