5'-O-dimethoxytrityl-1-(2'-deoxy-β-D-ribofuranosyl)pyrrole-2-carbaldehyde | 540522-55-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-dimethoxytrityl-1-(2'-deoxy-β-D-ribofuranosyl)pyrrole-2-carbaldehyde
• 英文别名: 1-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]pyrrole-2-carbaldehyde
• CAS: 540522-55-2
• 化学式: C₃₁H₃₁NO₆
• 分子量: 513.59
• InChiKey: IZGBKCYOZQNIJH-FRXPANAUSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.4
• 重原子数：
  38
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.26
• 拓扑面积：
  79.2
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-氰乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺 、 5'-O-dimethoxytrityl-1-(2'-deoxy-β-D-ribofuranosyl)pyrrole-2-carbaldehyde 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 2.0h， 以100%的产率得到3-[[(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-(2-formylpyrrol-1-yl)oxolan-3-yl]oxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxypropanenitrile
  参考文献：
  名称：

  吡咯-2-甲醛和9-甲基咪唑并[(4,5)-b]吡啶之间形状互补的非天然疏水碱基对

  摘要：

  一种非天然疏水性碱吡咯-2-甲醛（表示为 Pa）被开发为 9-甲基咪唑并 [(4,5)-b] 吡啶 (Q) 的特定配对伙伴。已知 Q 碱基与 2,4-二氟甲苯 (F) 作为 AT 对的等排体配对，并且 F 在复制中也与 A 有效配对。相比之下，Q-Pa 对在复制中表现出特异性选择性，五元环碱基 Pa 与 Q 有效配对，但与 A 配对较差。 此外，与 DNA 聚合酶相比，Pa 与 DNA 聚合酶的相互作用更好F.Pa的醛基被大肠杆菌DNA聚合酶I的Klenow片段和禽成髓细胞瘤病毒的逆转录酶很好地识别。通过核磁共振分析了DNA双链体中Q-Pa对的结构特征，显示了Pa与Q拟合的形状互补性。

  DOI：

  10.1021/ja028806h
• 作为产物：
  描述：

  2-吡咯甲醛 在 吡啶 、 氨 、 sodium hydride 作用下， 以 甲醇 、 乙腈 为溶剂， 反应 6.0h， 生成 5'-O-dimethoxytrityl-1-(2'-deoxy-β-D-ribofuranosyl)pyrrole-2-carbaldehyde
  参考文献：
  名称：

  吡咯-2-甲醛和9-甲基咪唑并[(4,5)-b]吡啶之间形状互补的非天然疏水碱基对

  摘要：

  一种非天然疏水性碱吡咯-2-甲醛（表示为 Pa）被开发为 9-甲基咪唑并 [(4,5)-b] 吡啶 (Q) 的特定配对伙伴。已知 Q 碱基与 2,4-二氟甲苯 (F) 作为 AT 对的等排体配对，并且 F 在复制中也与 A 有效配对。相比之下，Q-Pa 对在复制中表现出特异性选择性，五元环碱基 Pa 与 Q 有效配对，但与 A 配对较差。 此外，与 DNA 聚合酶相比，Pa 与 DNA 聚合酶的相互作用更好F.Pa的醛基被大肠杆菌DNA聚合酶I的Klenow片段和禽成髓细胞瘤病毒的逆转录酶很好地识别。通过核磁共振分析了DNA双链体中Q-Pa对的结构特征，显示了Pa与Q拟合的形状互补性。

  DOI：

  10.1021/ja028806h