1-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3-(β-alanyl)amino-1,2-propanediol | 253440-57-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 1-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3-(β-alanyl)amino-1,2-propanediol
• 英文别名: 3-amino-N-[3-[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]-2-hydroxypropyl]propanamide
• CAS: 253440-57-2
• 化学式: C₂₇H₃₂N₂O₅
• 分子量: 464.561
• InChiKey: WOJAGNZAJCCUJM-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.4
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.3
• 拓扑面积：
  103
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  1-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3-(N-benzyloxycarbonyl-β-alanyl)amino-1,2-propanediol 在 钯 氢气 作用下， 以 甲醇 、 氢氧化钾 、 乙酸乙酯 为溶剂， 以96%的产率得到1-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3-(β-alanyl)amino-1,2-propanediol
  参考文献：
  名称：

  Boronic acid containing oligonucleotides and polynucleotides

  摘要：

  本发明涉及核酸固定化、纯化和检测领域，更特别地，涉及硼酸修饰的寡核苷酸和多核苷酸，在生物偶联反应中有用。这些修饰的寡核苷酸和多核苷酸在大分子固定化和纯化反应中非常有用。

  公开号：

  US06013783A1

文献信息

• HYBRIDIZATION AND MISMATCH DISCRIMINATION USING OLIGONUCLEOTIDES CONJUGATED TO MINOR GROOVE BINDERS
  申请人：HEDGPETH JOEL

  公开号：US20090048427A1

  公开（公告）日：2009-02-19

  Conjugates between a minor groove binding molecule, such as the trimer of 1,2-dihydro-(3H)-pyrrolo[3,2-e]indole-7-carboxylate (CDPI 3 ), and an oligonucleotide form unusually stable hybrids with complementary target sequences, in which the tethered CDPI 3 group resides in the minor groove of the duplex. These conjugates can be used as probes and primers. Due to their unusually high binding affinity, conjugates as short as 8-mers can be used as amplification primers with high specificity and efficiency. MGB conjugation also increases the discriminatory power of short oligonucleotides, providing enhanced detection of nucleotide sequence mismatches by short oligonucleotides. The MGB-conjugated probes and primers described herein facilitate various analytic and diagnostic procedures, such as amplification reactions, PCR, detection of single-nucleotide polymorphisms, gene hunting, differential display, fluorescence energy transfer, hydrolyzable probe assays and others; by allowing the use of shorter oligonucleotides, which have higher specificity and better discriminatory power.

  一种小沟结合分子（例如1,2-二氢-（3H）-吡咯并[3,2-e]吲哚-7-羧酸三聚体（CDPI3））与寡核苷酸之间的共轭体形成与互补靶序列异常稳定的杂交体，在其中，被拴在一起的CDPI3基团位于双链的小沟中。这些共轭体可用作探针和引物。由于它们的结合亲和力异常高，因此即使是长度为8个碱基的共轭体也可用作具有高特异性和效率的扩增引物。MGB共轭还增加了短寡核苷酸的鉴别能力，通过短寡核苷酸提供了更好的核苷酸序列不匹配检测。所述的MGB共轭探针和引物可促进各种分析和诊断过程，例如扩增反应，PCR，单核苷酸多态性检测，基因寻找，差异显示，荧光能量转移，可水解探针测定等；通过使用更短的寡核苷酸，从而具有更高的特异性和更好的鉴别能力。
• BORONIC ACID CONTAINING REAGENTS AND OLIGONUCLEOTIDES
  申请人：PROLINX, INC.

  公开号：EP1165569A1

  公开（公告）日：2002-01-02
• US6013783A
  申请人：——

  公开号：US6013783A

  公开（公告）日：2000-01-11
• US6031117A
  申请人：——

  公开号：US6031117A

  公开（公告）日：2000-02-29
• US7556923B1
  申请人：——

  公开号：US7556923B1

  公开（公告）日：2009-07-07