9-(5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-O-[(2-cyanoethoxy)(N,N-diisopropylamino)phosphino]-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-β-D-ribofuranosyl)-2-propargylamino-purine | 1210052-23-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 9-(5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-O-[(2-cyanoethoxy)(N,N-diisopropylamino)phosphino]-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-β-D-ribofuranosyl)-2-propargylamino-purine
• 英文别名: 3-[[(2R,3R,4R,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-[2-(prop-2-ynylamino)purin-9-yl]oxolan-3-yl]oxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxypropanenitrile
• CAS: 1210052-23-5
• 化学式: C₄₉H₆₄N₇O₇PSi
• 分子量: 922.149
• InChiKey: NEHCRCAZHXNDHS-FSDMAFQZSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  9.85
• 重原子数：
  65
• 可旋转键数：
  22
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.47
• 拓扑面积：
  147
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  13

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2-cyanoethyl-(N,N-diisopropylamino)chlorophosphite 、 9-(5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-β-D-ribofuranosyl)-2-propargylamino-purine 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 5.0h， 以78%的产率得到9-(5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-O-[(2-cyanoethoxy)(N,N-diisopropylamino)phosphino]-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-β-D-ribofuranosyl)-2-propargylamino-purine
  参考文献：
  名称：

  N2 修饰的 2-氨基嘌呤核糖核苷作为双链 RNA 中的小沟调节腺苷替代物

  摘要：

  当掺入双链 RNA 时，将取代基投射到小沟中的核苷类似物会扰乱蛋白质的结合，并会影响碱基配对的特异性。描述了 2-氨基嘌呤核糖核苷类似物及其亚磷酰胺的合成、它们与双链 RNA 的结合、通过铜催化的叠氮化物-炔环加成 (CuAAC) 进行的合成后修饰，以及它们对双链稳定性和碱基配对特异性的影响。

  DOI：

  10.1021/ol100019r

文献信息

• <i>N</i>²-Modified 2-aminopurine ribonucleosides as minor-groove-modulating adenosine replacements in duplex RNA
  作者：Hayden Peacock、Olena Maydanovych、Peter A. Beal

  DOI：10.1021/ol100019r

  日期：2010.3.5

  Nucleoside analogs that project substituents into the minor groove when incorporated into duplex RNA perturb the binding of proteins and can affect base pairing specificity. The synthesis of 2-aminopurine ribonucleoside analogs and their phosphoramidites, their incorporation into duplex RNA, their postsynthetic modification via Cu-catalyzed azide−alkyne cycloaddition (CuAAC), and their effect on duplex

  当掺入双链 RNA 时，将取代基投射到小沟中的核苷类似物会扰乱蛋白质的结合，并会影响碱基配对的特异性。描述了 2-氨基嘌呤核糖核苷类似物及其亚磷酰胺的合成、它们与双链 RNA 的结合、通过铜催化的叠氮化物-炔环加成 (CuAAC) 进行的合成后修饰，以及它们对双链稳定性和碱基配对特异性的影响。