5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3-{2-[(2,4-dinitrophenyl)amino]ethyl}thymidine 3'-(2-cyanoethyl-N,N-diisopropylphosphoramidite) | 1263363-85-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3-{2-[(2,4-dinitrophenyl)amino]ethyl}thymidine 3'-(2-cyanoethyl-N,N-diisopropylphosphoramidite)
• CAS: 1263363-85-4
• 化学式: C₄₈H₅₆N₇O₁₂P
• 分子量: 953.986
• InChiKey: BBVMVQGZAWHBHW-XBPWWDSZSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.22
• 重原子数：
  68.0
• 可旋转键数：
  23.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.4
• 拓扑面积：
  224.72
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  17.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3-{2-[(2,4-dinitrophenyl)amino]ethyl}thymidine 、 双(二异丙基氨基)(2-氰基乙氧基)膦 在 四氮唑 作用下， 以 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 12.0h， 以76%的产率得到5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3-{2-[(2,4-dinitrophenyl)amino]ethyl}thymidine 3'-(2-cyanoethyl-N,N-diisopropylphosphoramidite)
  参考文献：
  名称：

  核苷酸。第LXXVIII部分

  摘要：

  几个Ñ（羟基烷基）-2,4-二硝基苯胺转化成它们的亚磷酰胺（参见5和6在方案1）鉴于它们作为荧光猝灭剂的使用，和改性的2-氨基苯甲酰胺（参见图9，10，18，和19在方案1中）在模型反应施加为荧光团，以确定3'-ABA的相对荧光量子产率和5'-DNP-3'-ABA共轭物（ABA =氨基苯甲酰胺，DNP =二硝基苯胺）。胸苷用N-（2-氯乙基）-2-，4-二硝基苯胺（24）烷基化，得到25，然后将其进一步修饰为结构单元27和28（方案3）。29中的2-氨基通过重氮化转化为2-氟肌苷衍生物30，用作在嘧啶核上进行数个反应的起始原料（→ 31、33和35；方案4）。3'，5'-二-O-乙酰基-2'-脱氧-N 2 -[（（二甲基氨基）亚甲基]鸟苷（37）被甲基和乙基碘化物优先在N（1）分别烷基化至43和44，并且类似地反应ñ - （2-氯乙基）-2,4-二硝基苯胺（24），以38和N-（2-碘乙基

  DOI：

  10.1002/hlca.201000253