5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-N6-[(1S,2R)-1-{[2-(trimethylsilyl)ethoxy]-carbonyl}-2-{[(tert-butyl)dimethylsilyl]oxy}propylaminocarbonyl]-2'-deoxyadenosine | 1233946-55-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-N6-[(1S,2R)-1-{[2-(trimethylsilyl)ethoxy]-carbonyl}-2-{[(tert-butyl)dimethylsilyl]oxy}propylaminocarbonyl]-2'-deoxyadenosine
• CAS: 1233946-55-8
• 化学式: C₄₇H₆₄N₆O₉Si₂
• 分子量: 913.231
• InChiKey: XMNLBGDYTOZKGW-HRINCCEUSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.28
• 重原子数：
  64.0
• 可旋转键数：
  18.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.47
• 拓扑面积：
  177.41
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  13.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-N6-[(1S,2R)-1-{[2-(trimethylsilyl)ethoxy]-carbonyl}-2-{[(tert-butyl)dimethylsilyl]oxy}propylaminocarbonyl]-2'-deoxyadenosine 、 2-氰乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.0h， 以57%的产率得到3'-O-(2-cyanoethyl-N,N-diisopropylaminophosphinoxy)-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-N6-[(1S,2R)-1-{[2-(trimethylsilyl)ethoxy]carbonyl}-2-{[(tert-butyl)dimethylsilyl]oxy}propylaminocarbonyl]-2'-deoxyadenosine
  参考文献：
  名称：

  RNA-cleaving 10–23 deoxyribozyme with a single amino acid-like functionality operates without metal ion cofactors

  摘要：

  通过化学合成获得了一系列 10â23 个脱氧核糖核酸酶（D2âD9），它们在催化核心的第 4、5、8 或 15 位含有单个氨基酸核苷（thr6dA、hisam6dA、hisam5dU 和 ncmnm5dU）。对这些脱氧核糖酶的催化效率进行了筛选，发现在 1 mM Mg2+ 的存在下，其中两种在第 8 位含有 hisam5dU（D8）或 ncmnm5dU（D9）的 RNA 核酶的活性是其未修饰前体的数倍。此外，在无镁的 TRIS 或 PIPES 缓冲液中，这些酶能够催化位于互补 RNA 底物的 5â²-GpU-3â² 序列之间的磷酸二酯键的裂解。当 pH 值大于 7 时，裂解反应的效率最高。

  DOI：

  10.1039/b9nj00705a
• 作为产物：
  描述：

  3′,5′‑di‑O‑acetyl‑N6‑phenoxycarbonyl‑2′‑deoxyadenosine 在 吡啶 、 氨 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 96.0h， 生成 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-N6-[(1S,2R)-1-{[2-(trimethylsilyl)ethoxy]-carbonyl}-2-{[(tert-butyl)dimethylsilyl]oxy}propylaminocarbonyl]-2'-deoxyadenosine
  参考文献：
  名称：

  RNA-cleaving 10–23 deoxyribozyme with a single amino acid-like functionality operates without metal ion cofactors

  摘要：

  通过化学合成获得了一系列 10â23 个脱氧核糖核酸酶（D2âD9），它们在催化核心的第 4、5、8 或 15 位含有单个氨基酸核苷（thr6dA、hisam6dA、hisam5dU 和 ncmnm5dU）。对这些脱氧核糖酶的催化效率进行了筛选，发现在 1 mM Mg2+ 的存在下，其中两种在第 8 位含有 hisam5dU（D8）或 ncmnm5dU（D9）的 RNA 核酶的活性是其未修饰前体的数倍。此外，在无镁的 TRIS 或 PIPES 缓冲液中，这些酶能够催化位于互补 RNA 底物的 5â²-GpU-3â² 序列之间的磷酸二酯键的裂解。当 pH 值大于 7 时，裂解反应的效率最高。

  DOI：

  10.1039/b9nj00705a