pyridinium 4-(6-(5-(1,2-dithiolan-3-yl)pentanamido)-2-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy) methyl)hexyloxy)-4-oxobutanoate | 1610359-33-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: pyridinium 4-(6-(5-(1,2-dithiolan-3-yl)pentanamido)-2-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy) methyl)hexyloxy)-4-oxobutanoate
• CAS: 1610359-33-5
• 化学式: C₅H₅N*C₄₀H₅₁NO₈S₂
• 分子量: 817.08
• InChiKey: OCJFMHCDQFVGFO-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  9.12
• 重原子数：
  57.0
• 可旋转键数：
  23.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.42
• 拓扑面积：
  133.28
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  10.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  6-amino-2-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)hexan-1-ol 在 4-二甲氨基吡啶 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 32.83h， 生成 pyridinium 4-(6-(5-(1,2-dithiolan-3-yl)pentanamido)-2-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy) methyl)hexyloxy)-4-oxobutanoate
  参考文献：
  名称：

  Dithiolane Based Thiol Modifier For Labeling and Stronger Immobilization of Bio-Molecules On Solid Surfaces

  摘要：

  巯基修饰的寡核苷酸在核酸化学领域有广泛的应用。单巯基基团生成的共轭物在高温、高盐浓度缓冲液和存在其他巯基的情况下不稳定。因此，有必要开发一种能够生成多个巯基基团的新型巯基修饰探针。本文描述了高效的工艺和化合物，包括二硫杂环磷酰胺衍生物和二硫杂环琥珀酰基支持体。我们的环状二硫化物巯基修饰的优点是多方面的：a)每个插入点引入两个巯基基团；b)它可以在寡核苷酸的任何所需位置引入；c)二硫杂环中链臂的对称分支性质允许进行干净的寡核苷酸合成，避免链臂的断裂和寡核苷酸链的损失。我们成功地制备了包含单个二硫杂环衍生物的20-mer寡核苷酸，在3'端，以及包含单个二硫杂环衍生物的21-mer寡核苷酸，在5'端或混合碱基序列的中间。这些寡核苷酸的HPLC和ESI MS分析表明它们的纯度和组成正确。

  公开号：

  US20140142253A1