({(2-{[(4-Methoxy-phenyl)-diphenyl-methyl]-amino}-ethyl)-[2-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-acetyl]-amino}-methyl)-phosphonic acid monophenyl ester | 203643-20-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: ({(2-{[(4-Methoxy-phenyl)-diphenyl-methyl]-amino}-ethyl)-[2-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-acetyl]-amino}-methyl)-phosphonic acid monophenyl ester
• CAS: 203643-20-3
• 化学式: C₃₆H₃₇N₄O₇P
• 分子量: 668.686
• InChiKey: XDTRGNTYYLDDCH-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.49
• 重原子数：
  48.0
• 可旋转键数：
  14.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.19
• 拓扑面积：
  142.96
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  8.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  ({(2-{[(4-Methoxy-phenyl)-diphenyl-methyl]-amino}-ethyl)-[2-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-acetyl]-amino}-methyl)-phosphonic acid monophenyl ester 在 吡啶 、 4-甲氧基吡啶-N-氧化物 、 2,4,6-三异丙基苯磺酰氯 、 水 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 0.75h， 生成 ({(2-{[(4-Methoxy-phenyl)-diphenyl-methyl]-amino}-ethyl)-[2-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-acetyl]-amino}-methyl)-phosphonic acid mono-(1-oxy-pyridin-2-ylmethyl) ester
  参考文献：
  名称：

  PNA-（5'）-DNA嵌合体的结合特性的优化。

  摘要：

  在连接处包含5'-酰胺（即1a），5'-磷酸二酯（即1b）或5'-膦酸酯键（即1c，d）的PNA-（5'）-DNA嵌合体的合成和评估网站介绍。可以使用5'-氨基-5'-脱氧胸苷亚磷酰胺2，O- [2-（2-氨基乙基）-（胸腺嘧啶-1-基乙酰基）氨基]乙基亚磷酰胺3，N-（2 -氨基乙基）-N-（胸腺嘧啶-1-基乙酰基）氨基甲基膦酸酯4或N-（2-氨基乙基）-N-（烯丙氧基羰基）氨基甲基膦酸酯5作为构建基。结果表明，1a-c型PNA-（5'）-DNA与互补RNA的结合亲和力比天然DNA高，反义活性主要归因于RNase H.

  DOI：

  10.1016/s0960-894x(98)00088-2
• 作为产物：
  描述：

  ({(2-Amino-ethyl)-[2-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-acetyl]-amino}-methyl)-phosphonic acid diphenyl ester 在 吡啶 、 水 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 作用下， 以 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 4.25h， 生成 ({(2-{[(4-Methoxy-phenyl)-diphenyl-methyl]-amino}-ethyl)-[2-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydro-2H-pyrimidin-1-yl)-acetyl]-amino}-methyl)-phosphonic acid monophenyl ester
  参考文献：
  名称：

  PNA-（5'）-DNA嵌合体的结合特性的优化。

  摘要：

  在连接处包含5'-酰胺（即1a），5'-磷酸二酯（即1b）或5'-膦酸酯键（即1c，d）的PNA-（5'）-DNA嵌合体的合成和评估网站介绍。可以使用5'-氨基-5'-脱氧胸苷亚磷酰胺2，O- [2-（2-氨基乙基）-（胸腺嘧啶-1-基乙酰基）氨基]乙基亚磷酰胺3，N-（2 -氨基乙基）-N-（胸腺嘧啶-1-基乙酰基）氨基甲基膦酸酯4或N-（2-氨基乙基）-N-（烯丙氧基羰基）氨基甲基膦酸酯5作为构建基。结果表明，1a-c型PNA-（5'）-DNA与互补RNA的结合亲和力比天然DNA高，反义活性主要归因于RNase H.

  DOI：

  10.1016/s0960-894x(98)00088-2