5'-O-(monomethoxytrityl)-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridine 3'-O-(methyl N,N-diisopropylphosphoramidite) | 101904-24-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-(monomethoxytrityl)-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridine 3'-O-(methyl N,N-diisopropylphosphoramidite)
• 英文别名: 5'-O-(monomethoxytrityl)-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridine 3'-N,N-diisopropylmethylphosphoramidite；1-[(2R,3R,4R,5R)-3-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-4-[[di(propan-2-yl)amino]-methoxyphosphanyl]oxy-5-[[(4-methoxyphenyl)-diphenylmethoxy]methyl]oxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 101904-24-9
• 化学式: C₄₂H₅₈N₃O₈PSi
• 分子量: 791.997
• InChiKey: RDXVYQQOCKQYJI-KCTKLGORSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.22
• 重原子数：
  55
• 可旋转键数：
  17
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.48
• 拓扑面积：
  108
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-(monomethoxytrityl)-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridine 3'-O-(methyl N,N-diisopropylphosphoramidite) 在 四氮唑 、 2,3,5-三甲基吡啶 、 碘 、 三氯乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 0.33h， 生成
  参考文献：
  名称：

  A study on the alkylsilyl groups in oligoribonucleotide synthesis

  摘要：

  DOI：

  10.1021/jo00302a044
• 作为产物：
  描述：

  氯(二异丙基氨基)甲氧基膦 、 2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-5'-O-(4-methoxytrityl)uridine 在 4-二甲氨基吡啶 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 3.0h， 以99%的产率得到5'-O-(monomethoxytrityl)-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridine 3'-O-(methyl N,N-diisopropylphosphoramidite)
  参考文献：
  名称：

  Preparation of ribonucleoside 3′-O-phosphoramidites and their application to the automated solid phase synthesis of oligonucleotides

  摘要：

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(00)98753-7

文献信息

• The automated chemical synthesis of long oligoribuncleotides using 2'-O-silylated ribonucleoside 3'-O-phosphoramidites on a controlled-pore glass support: synthesis of a 43-nucleotide sequence similar to the 3'-half molecule of an Escherichia coli formylmethionine tRNA
  作者：N. Usman、K. K. Ogilvie、M. Y. Jiang、R. J. Cedergren

  DOI：10.1021/ja00259a037

  日期：1987.12
• Synthesis and spectroscopic analysis of branched RNA fragments: messenger RNA splicing intermediates
  作者：Masad J. Damha、Kelvin K. Ogilvie

  DOI：10.1021/jo00251a010

  日期：1988.8
• WU, TAIFENG;OGILVIE, KELVIN K., J. ORG. CHEM., 55,(1990) N5, C. 4717-4724
  作者：WU, TAIFENG、OGILVIE, KELVIN K.

  DOI：——

  日期：——
• POMAHOBA, E. A.;ORETSKAYA, T. S.;SUXOMLINOV, V. V.;KRYNETSKAYA, N. F.;MET+, BIOORGAN. XIMIYA, 16,(1990) N0, S. 1348-1354
  作者：POMAHOBA, E. A.、ORETSKAYA, T. S.、SUXOMLINOV, V. V.、KRYNETSKAYA, N. F.、MET+

  DOI：——

  日期：——
• DAMHA, MASAD J.;OGILVIE, KELVIN K., J. ORG. CHEM., 53,(1988) N 16, C. 3864
  作者：DAMHA, MASAD J.、OGILVIE, KELVIN K.

  DOI：——

  日期：——