5'-O-[(tert-butyl)dimethylsilyl]-2'-O-levulinoyl-N6-(4-methoxytrityl)-3'-O-[(methylsulfanyl)methyl]-adenosine | 1166394-03-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-[(tert-butyl)dimethylsilyl]-2'-O-levulinoyl-N6-(4-methoxytrityl)-3'-O-[(methylsulfanyl)methyl]-adenosine
• 英文别名: 5'-O-[(tert-butyl)(dimethyl)silyl]-N6-[(4-methoxyphenyl)(diphenyl)methyl]-3'-O-[(methylsulfanyl)methyl]-2'-O-(4-oxopentanoyl)adenosine
• CAS: 1166394-03-1
• 化学式: C₄₃H₅₃N₅O₇SSi
• 分子量: 812.075
• InChiKey: UIDOKXZKAAQEBP-VYRNGDHESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.14
• 重原子数：
  57.0
• 可旋转键数：
  17.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.42
• 拓扑面积：
  135.92
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  13.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-[(tert-butyl)dimethylsilyl]-2'-O-levulinoyl-N6-(4-methoxytrityl)-3'-O-[(methylsulfanyl)methyl]-adenosine 在 二苯并-18-冠醚-6 、 氯化亚砜 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 3'-O-[(acetyloxy)methyl]-5'-O-[(tert-butyl)(dimethyl)silyl]-N6-[(4-methoxyphenyl)(diphenyl)-methyl]-2'-O-(4-oxopentanoyl)adenosine
  参考文献：
  名称：

  可生物降解保护的二核苷酸2'，5'-单磷酸酯的合成和酶促脱保护：3'-O-（酰氧基甲基）腺苷基-2'，5'-的3-（乙酰氧基）-2,2-双（乙氧基羰基）丙基磷酸酯腺苷。

  摘要：

  迈向针对短寡核糖核苷酸（例如2-5A及其同类物）的可行前药策略的第一步，是在末端带有3-（乙酰氧基）-2,2-双（乙氧基羰基）丙基的腺苷基2'，5'-腺苷制备磷酸酯部分，并制备2'-连接核苷的（乙酰氧基）甲基或（新戊酰氧基）甲基保护的3'-OH基。已经研究了通过猪肝脏羧酯酶在pH 7.5和37°下用酶触发的方法去除这些保护基。事实证明，（乙酰氧基）甲基对于3'-O-保护来说太不稳定了，它的去除速度比磷酸酯保护基要快，这导致2'，5'-到3'，5'-异构化。核苷间磷酸酯键。另外，原料意外地转化为5'-O-乙酰化衍生物。（新戊酰氧基）甲基似乎更适合该目的。完全脱保护的2'，5'-ApA作为主要产物积累，尽管即使在这种情况下，也会发生原料的异构化。

  DOI：

  10.1002/cbdv.201000288
• 作为产物：
  描述：

  (2R,3R,4S,5R)-2-(6-amino-9H-purin-9-yl)-5-(((tert-butyldimethylsilyl)oxy)methyl)-4-((methylthio)methoxy)tetrahydrofuran-3-ol 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 作用下， 生成 5'-O-[(tert-butyl)dimethylsilyl]-2'-O-levulinoyl-N6-(4-methoxytrityl)-3'-O-[(methylsulfanyl)methyl]-adenosine
  参考文献：
  名称：

  可生物降解保护的二核苷酸2'，5'-单磷酸酯的合成和酶促脱保护：3'-O-（酰氧基甲基）腺苷基-2'，5'-的3-（乙酰氧基）-2,2-双（乙氧基羰基）丙基磷酸酯腺苷。

  摘要：

  迈向针对短寡核糖核苷酸（例如2-5A及其同类物）的可行前药策略的第一步，是在末端带有3-（乙酰氧基）-2,2-双（乙氧基羰基）丙基的腺苷基2'，5'-腺苷制备磷酸酯部分，并制备2'-连接核苷的（乙酰氧基）甲基或（新戊酰氧基）甲基保护的3'-OH基。已经研究了通过猪肝脏羧酯酶在pH 7.5和37°下用酶触发的方法去除这些保护基。事实证明，（乙酰氧基）甲基对于3'-O-保护来说太不稳定了，它的去除速度比磷酸酯保护基要快，这导致2'，5'-到3'，5'-异构化。核苷间磷酸酯键。另外，原料意外地转化为5'-O-乙酰化衍生物。（新戊酰氧基）甲基似乎更适合该目的。完全脱保护的2'，5'-ApA作为主要产物积累，尽管即使在这种情况下，也会发生原料的异构化。

  DOI：

  10.1002/cbdv.201000288