affinity-based probe KPlip to interrogate the interactions of lipoylated peptide/proteins under native cellular environment. Large-scale chemical proteomics analysis revealed a number of binding proteins of KPlip, including Sirt2, an NAD+-dependent protein deacylase. To explore the potential activity of Sirt2 toward lysine lipoylation, we designed a single-step fluorogenic probe KTlip, which reports delipoylation
Lysine lipoy
LAtion 是一种高度保守的赖
氨酸
PTM,在调节细胞代谢中起着关键作用。许多重要代谢蛋白(例如
丙酮酸脱氢酶 (PDH))的催化活性取决于赖
氨酸脂酰化。尽管其重要作用,赖
氨酸脂酰化的详细
生物学调控机制在很大程度上仍未被探索。在此,我们设计了一种强大的基于亲和力的探针 KPlip 来研究天然细胞环境下脂解肽/蛋白质的相互作用。大规模
化学蛋白质组学分析揭示了 KPlip 的许多结合蛋白,包括 Sirt2,一种
NAD+ 依赖性蛋白质脱酰基酶。为了探索 Sirt2 对赖
氨酸脂肪化的潜在活性,我们设计了一种单步荧光探针 KTlip,它以连续的方式报告去脂肪化活性。结果表明,Sirt2 导致 KTlip 的显着脱脂,在测定中显示出高达 60 倍的荧光增加。不同肽底物的进一步动力学实验表明,Sirt2 可以催化肽 (D
LAT-PDH, K259) 的脱脂,催化效率 (kcat/Km)