3’-O-(tert-butyldimethylsilyl)-5’-O-(4,4’-dimethoxytrityl)-5-iodo-2’,3’-secouridine | 1608117-54-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 3’-O-(tert-butyldimethylsilyl)-5’-O-(4,4’-dimethoxytrityl)-5-iodo-2’,3’-secouridine
• 英文别名: 1-((R)-1-(((R)-1-(Bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)-3-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)propan-2-yl)oxy)-2-hydroxyethyl)-5-iodopyrimidine-2,4(1H,3H)-dione；1-[(1R)-1-[(2R)-1-[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]-3-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxypropan-2-yl]oxy-2-hydroxyethyl]-5-iodopyrimidine-2,4-dione
• CAS: 1608117-54-9
• 化学式: C₃₆H₄₅IN₂O₈Si
• 分子量: 788.752
• InChiKey: OFPFQOCUEXOIRA-XLJNKUFUSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.07
• 重原子数：
  48.0
• 可旋转键数：
  15.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.39
• 拓扑面积：
  121.24
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  9.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3’-O-(tert-butyldimethylsilyl)-5’-O-(4,4’-dimethoxytrityl)-5-iodo-2’,3’-secouridine 、 1-芘硼酸 在 palladium diacetate 、 sodium carbonate 、 三苯基膦 作用下， 以 水 、 甲苯 为溶剂， 反应 1.0h， 以57%的产率得到3’-O-(tert-butyldimethylsilyl)-5’-O-(4,4’-dimethoxytrityl)-5-(pyren-1-yl)-2’,3’-secouridine
  参考文献：
  名称：

  P修饰尿嘧啶的开环核酸：合成，杂交研究，荧光性质和i-Motif稳定性

  摘要：

  释放潜力：在合成新的pyr修饰的UNA结构单元时，我们已将a部分与尿嘧啶碱基直接偶联。含有凸起结合的pyr修饰的UNA单体的寡核苷酸显示出增加的双链体热稳定性，而在完全匹配的双链体和i-基序中观察到去稳定作用。

  DOI：

  10.1002/cbic.201300567
• 作为产物：
  描述：

  5’-O-(4,4’-dimethoxytrityl)-5-iodo-2',3'-secouridine 在 吡啶 、 水 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 作用下， 以 吡啶 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 3.16h， 生成 3’-O-(tert-butyldimethylsilyl)-5’-O-(4,4’-dimethoxytrityl)-5-iodo-2’,3’-secouridine
  参考文献：
  名称：

  P修饰尿嘧啶的开环核酸：合成，杂交研究，荧光性质和i-Motif稳定性

  摘要：

  释放潜力：在合成新的pyr修饰的UNA结构单元时，我们已将a部分与尿嘧啶碱基直接偶联。含有凸起结合的pyr修饰的UNA单体的寡核苷酸显示出增加的双链体热稳定性，而在完全匹配的双链体和i-基序中观察到去稳定作用。

  DOI：

  10.1002/cbic.201300567