9-{{2-[(4,4'-dimethoxytrityl)oxy]etoxy}methyl}adenine | 201855-19-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 9-{{2-[(4,4'-dimethoxytrityl)oxy]etoxy}methyl}adenine
• 英文别名: 9-[2-[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]ethoxymethyl]purin-6-amine
• CAS: 201855-19-8
• 化学式: C₂₉H₂₉N₅O₄
• 分子量: 511.58
• InChiKey: OUKXMRDNCYKZLX-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  694.8±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.25±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.41
• 重原子数：
  38.0
• 可旋转键数：
  11.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.21
• 拓扑面积：
  106.54
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  9.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  9-{{2-[(4,4'-dimethoxytrityl)oxy]etoxy}methyl}adenine 在 三乙胺 作用下， 以 吡啶 为溶剂， 反应 6.0h， 生成 3'-deoxyadenylyl-(2'-5')-2'adenylic acid 2'{2-[(adenin-9-yl)methoxy]ethyl} ester
  参考文献：
  名称：

  核苷酸。第五部分。固相合成修饰寡核苷酸的新型接头的合成与应用†

  摘要：

  研究了各种双官能氨基保护基团，例如邻苯二甲酰基，琥珀酰基和戊二酰基作为潜在的连接分子，用于连接到固相支持物上。戊烷1,3,5-三羧酸1,3-酐（16）具有最佳性能，并与不同糖保护的腺苷（参见20和22），胞苷（参见29）和鸟苷衍生物的氨基反应（见32），以相应的2-（2-羧乙基）戊二衍生物23，24，30，和33。潜在的抗病毒活性3'-脱氧腺苷基-（2'-5'）-2'-腺苷酸2'-{2-[（腺嘌呤- -9-基）甲氧基]乙基}酯（38）从所述2'-端开始ñ 6，ñ 6 - [2-（2-羧乙基）戊二酰] -9 - {{2 - [（4,4'-二甲氧基三苯甲基）乙氧基]甲基}腺嘌呤（12）。

  DOI：

  10.1002/hlca.19980810106
• 作为产物：
  描述：

  1-[(2-羟基乙氧基)甲基]腺嘌呤 、 4,4'-双甲氧基三苯甲基氯 以 吡啶 为溶剂， 反应 8.0h， 以91%的产率得到9-{{2-[(4,4'-dimethoxytrityl)oxy]etoxy}methyl}adenine
  参考文献：
  名称：

  核苷酸。第五部分。固相合成修饰寡核苷酸的新型接头的合成与应用†

  摘要：

  研究了各种双官能氨基保护基团，例如邻苯二甲酰基，琥珀酰基和戊二酰基作为潜在的连接分子，用于连接到固相支持物上。戊烷1,3,5-三羧酸1,3-酐（16）具有最佳性能，并与不同糖保护的腺苷（参见20和22），胞苷（参见29）和鸟苷衍生物的氨基反应（见32），以相应的2-（2-羧乙基）戊二衍生物23，24，30，和33。潜在的抗病毒活性3'-脱氧腺苷基-（2'-5'）-2'-腺苷酸2'-{2-[（腺嘌呤- -9-基）甲氧基]乙基}酯（38）从所述2'-端开始ñ 6，ñ 6 - [2-（2-羧乙基）戊二酰] -9 - {{2 - [（4,4'-二甲氧基三苯甲基）乙氧基]甲基}腺嘌呤（12）。

  DOI：

  10.1002/hlca.19980810106

文献信息

• Nucleotides Part LXX
  作者：Ramamurthy Charubala、Wolfgang Pfleiderer、Robert J. Suhadolnik、Kathryn T. Iacono、Nicholas F. Muto、Joseph W. Homan、Camille Martinand-Mari、Susan E. Horvath、Earl E. Henderson、Amber Steele、Thomas J. Rogers

  DOI：10.1002/1522-2675(200208)85:8<2284::aid-hlca2284>3.0.co;2-e

  日期：2002.8

  The chemical syntheses of nuclease-resistant, nontoxic bioactive (2'-5')agonists, 3'-deoxyadenylyl-(2'-->5')3'-deoxyadenylyl-(2'-->5')-3'-deoxyadenylyl-(2'-->2")-9-[(2"-hydroxyethoxy)methyl]adenine (d(3)A-d(3)A-d(3)A-etherA; 36), 1-benzyl-3'-deoxyadenylyl-(2'-->5')-3'-deoxyadenylyl-(2'-->5')-3'-deoxyadenylyl-(2'-->2")-9-[2"-hydroxyethoxy)methyl]adenine (N-1-benzyl-d(3)A-d(3)A-d(3)A-etherA; 37), N-6-benzyl-3'-deoxyadenylyl-(2'-5')3'-deoxyadenylyl-(2'-->5')-3'-deoxyadenylyl-(2'-->2")-9-[(2"-hydroxyethoxy)methyl]adenine (N-6-benzyl-d(3)Ad(3)A-d(3)A-etherA; 38), N-6-benzyladenylyl-(2'-->5')-adenylyl-(2'-->5')-adenylyl-(2'-->2")-9-[(2"-hydroxyethoxy)methyl]adenine (N-6-benzyl-A-A-A-etherA; 39), as well as the biological activities of 37, 38, and already synthesized and published adenylyl-(2'-->5')-adenylyl-(2'-->5')-adenylyl-(2'-->2")-9-[(2"-hydroxyethoxy)methyl]adenine (A-A-A-etherA; 40), are described. The above (2'-5')A derivatives 37-40 inhibit HIV-1 replication as measured by inhibition of syncytia formation, HIV-1 reverse transcriptase activity, or HIV-1 p24-antigen expression, with no evidence of cytotoxicity. Oligonucleotides 37, 38, and 40 were taken up intact into T cells in culture of cytoplasmic concentrations sufficient to activate the latent endoribonuclease, RNase L. N-6-Benzyl-d(3)A-d(3)A-d(3)A-etherA (38) also exerts immunostimulatory effects by increasing expression of monocyte chemotactic protein-1 (MCP-1), and, thereby, competing with HIV-1 for binding to a critical HIV-coreceptor.