N-Z-didemnin A | 110720-12-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 肽模拟物
• 英文名称: N-Z-didemnin A
• 英文别名: Z-didemnin A；benzyl N-[(2R)-1-[[(3S,6S,8S,12S,13R,16S,17R,20S,23S)-13-[(2S)-butan-2-yl]-12-hydroxy-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-2,5,7,10,15,19,22-heptaoxo-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxopentan-2-yl]-N-methylcarbamate
• CAS: 110720-12-2
• 化学式: C₅₇H₈₄N₆O₁₄
• 分子量: 1077.33
• InChiKey: VQQBSKWGCPFCQD-DUMGPQJDSA-N

物化性质

• 沸点：
  1210.1±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.22±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.6
• 重原子数：
  77
• 可旋转键数：
  16
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.63
• 拓扑面积：
  257
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  14

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-Z-didemnin A 在 palladium on activated charcoal 2,3,5-三甲基吡啶 、 氢气 作用下， 以 盐酸 、 二氯甲烷 、 溶剂黄146 、 异丙醇 为溶剂， 20.0 ℃ 、100.0 kPa 条件下， 反应 9.0h， 生成 N-[13-丁烷-2-基-12-羟基-20-[(4-甲氧基苯基)甲基]-6,17,21-三甲基-3-(2-甲基丙基)-2,5,7,10,15,19,22-七氧代-8-丙基-9,18-二氧杂-1,4,14,21-四氮杂双环[21.3.0]二十六烷-16-基]-2-(2-羟基丙酰基-甲基氨基)-4-甲基戊烷酰胺
  参考文献：
  名称：

  Total Synthesis of the Didemnins; IV.¹Synthesis of the Peptolide Ring and Construction of the Side Chain

  摘要：

  描述了双德米宁 A、B 和 C (1-3) 的全合成，该合成能够以十克的量制备这些高细胞毒性环肽。 β-酮酸单元（羟基异戊酰）丙酸衍生物（Hip，6）是通过甲基丙二酸二苄酯的酰化以及随后通过三氯化硼的作用裂解苄基来制备的。通过 DCC 方法激活游离的 β-酮酸 6，并使其与亮氨酸酯 7 反应以提供酰胺 8。通过五氟苯酯方法在两个步骤中对线性肽 19 进行激活、脱保护和闭环。 -相系统在几分钟内以75%的产率产生了二德明宁环骨架。然后，通过将 Z-(R)-N-甲基亮氨酸活化为其 3-氰基-2-吡啶硫醇酯，然后与 Z-乳酰脯氨酸氯化物和 Z-乳酸反应，将各自的侧链轻松且高产率地连接到二聚宁环上酰氯。

  DOI：

  10.1055/s-1991-26448
• 作为产物：
  描述：

  cyclo--5-methylheptanoyl>oxy-3-hydroxy-2,5-dimethylhexanoyl>-L-leucyl>-L-prolyl-N,O-dimethyl-L-tyrosyl>-L-threonyl> 在 N-甲基吗啉 、 盐酸 、 (benzotriazo-1-yloxy)tris(dimethylamino)phosphonium hexafluorophosphate 、 二甲基亚砜 、 三氟乙酸酐 作用下， 以 二氯甲烷 、 乙酸乙酯 为溶剂， 反应 10.5h， 生成 N-Z-didemnin A
  参考文献：
  名称：

  didemnins A、B 和 C 的全合成和结构研究

  摘要：

  Didemnins A、B 和 C 以立体控制的方式有效制备，产生常见的大环，并在单独的步骤中，在 L-苏氨酸的氨基上引入取代基作为光学纯单元。我们设想 L-亮氨酸和 HIP 基团 (2S,4S) 之间以及 L-苏氨酸和异司他汀 (3S,4R,5S) 之间的断开将提供两个单元：HIP-异司他汀单元 (I) 和四肽单元 (II) )

  DOI：

  10.1021/ja00177a030

文献信息

• Structure−Activity Relationships of the Didemnins
  作者：Ryuichi Sakai、Kenneth L. Rinehart、Vimal Kishore、Bijoy Kundu、Glynn Faircloth、James B. Gloer、John R. Carney、Michio Namikoshi、Furong Sun、Robert G. Hughes,、Dolores García Grávalos、Teresa García de Quesada、George R. Wilson、Richard M. Heid

  DOI：10.1021/jm960048g

  日期：1996.1.1

  Bioactivities of 42 didemnin congeners, either isolated from the marine tunicates Trididemnun solidum and Aplidium albicans or prepared synthetically and semisynthetically, have been compared. The growth inhibition of various murine and human tumor cells and plaque reduction of HSV-1 and VSV grown on cultured mammalian cells were used to assess cytotoxicity and antiviral activity. Biochemical assays for macromolecular

  比较了从海生被膜Trididemnun solidum和Aplidium Albicans分离或合成和半合成制备的42种双氢精蛋白同类物的生物活性。各种鼠类和人类肿瘤细胞的生长抑制作用以及在培养的哺乳动物细胞上生长的HSV-1和VSV的噬斑减少用于评估细胞毒性和抗病毒活性。还进行了大分子合成（蛋白质，DNA和RNA）和酶抑制（二氢叶酸还原酶，胸苷酸合酶，DNA聚合酶，RNA聚合酶以及拓扑异构酶I和II）的生化分析，以阐明每种类似物的作用机理。使用混合淋巴细胞反应（MLR）测定法确定双氢辅酶的免疫抑制活性。这些测定法揭示了天然环状二肽肽核心是双嘧达明的大部分生物活性的基本结构要求，特别是对于细胞毒性和抗病毒活性。在某些情况下，可以通过增加生物活性来改变肽的线性侧链部分。特别是针对小鼠的几种类型的肿瘤细胞和体内研究测试的脱氢美地那宁B，以及针对鼠类系统中混合淋巴细胞反应和移植物与宿主反应的测试
• Total synthesis of the didemnins - 2. Synthesis of didemnin A, B, C and prolyldidemnin A
  作者：U. Schmidt、M. Kroner、H. Griesser

  DOI：10.1016/s0040-4039(00)80507-9

  日期：1988.1

  Didemnin A, C, prolyldidemnin A and the highly cancerostatic, antiviral and immunosuppressive didemnin B have been prepared by deprotecting the benzyloxycarbonyl compound 5 and constructing the side chain that determines the biological properties.

  通过使苄氧羰基化合物5脱保护并构建决定生物学特性的侧链，制备了二氢肌酐A，C，脯氨二醛A以及高度抗癌，抗病毒和免疫抑制的二氢肌酐B。
• Synthetic methods for aplidine and new antitumoral derivatives, methods of making and using them
  申请人：Rodriguez Ignacio

  公开号：US20080009435A1

  公开（公告）日：2008-01-10

  The invention relates to aplidine derivatives of the general formula: which are useful for the treatment of tumors.

  本发明涉及一种通式为的aplidine衍生物，其可用于治疗肿瘤。
• Synthesis of New Didemnin B Analogs for Investigations of Structure/Biological Activity Relationships
  作者：Scott C. Mayer、Joshi Ramanjulu、Matthew D. Vera、Amy J. Pfizenmayer、Madeleine M. Joullie

  DOI：10.1021/jo00097a022

  日期：1994.9

  Modifications were introduced in the side chain of didemnin B to afford several analogs (1f-1j) for biological testing in order to identify the features responsible for the bioactivity of the natural products (1a-1c). To achieve our goal, two changes were made in the proline ring of the beta-turn side chain. Initially, a hydroxyl group was incorporated at the C-4 position of the ring to increase the polar nature of the molecule. Secondly, unsaturation was introduced at C-3 and C-4 to increase the rigidity of the ring and to provide a site for tritiation to follow the drug pathway in biological systems. Improvements were also introduced in the macrocycle construction to produce gram quantities of this unit (1d) for the preparation of the planned analogs. The linear precursor to the macrocycle was oxidized more effectively with 1,1,1-triacetoxy-1,1-dihydro-1,2-benziodoxol-3(1H)-one (Dess-Martin periodinane reagent), and cyclization yields were increased substantially by using a new coupling reagent, pentafluorophenyl diphenylphosphinate (FDPP). (1H-1,2,3-benzotriazol-1-yloxy)tris(dimethylamino)phosphonium hexafluorophosphate (BOP) and pentafluorophenyl trifluoroacetate were also used to improve other coupling reactions.
• RINEHART, KENNETH L.;KISHORE, VIMAL;BIBLE, KEITH C.;SAKAI, RYUICHI;SULLIN+, J. NATUR. PROD., 51,(1988) N 1, 1-21
  作者：RINEHART, KENNETH L.、KISHORE, VIMAL、BIBLE, KEITH C.、SAKAI, RYUICHI、SULLIN+

  DOI：——

  日期：——