N⁴-benzoyl-5'-O-(monomethoxytrityl)-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)cytidine 3'-N,N-diisopropylmethylphosphoramidite | 101904-22-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: N⁴-benzoyl-5'-O-(monomethoxytrityl)-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)cytidine 3'-N,N-diisopropylmethylphosphoramidite
• 英文别名: N-[1-[(2R,3R,4R,5R)-3-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-4-[[di(propan-2-yl)amino]-methoxyphosphanyl]oxy-5-[[(4-methoxyphenyl)-diphenylmethoxy]methyl]oxolan-2-yl]-2-oxopyrimidin-4-yl]benzamide
• CAS: 101904-22-7
• 化学式: C₄₉H₆₃N₄O₈PSi
• 分子量: 895.12
• InChiKey: NMTAWKIHJCWSGP-YTDZJJQLSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  10.18
• 重原子数：
  63
• 可旋转键数：
  19
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.41
• 拓扑面积：
  120
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N⁴-benzoyl-5'-O-(monomethoxytrityl)-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)cytidine 3'-N,N-diisopropylmethylphosphoramidite 、 2,3-di-O-acetyluridine 在 四氮唑 、 2,3,5-三甲基吡啶 、 碘 作用下， 生成 [(2R,3R,4R,5R)-4-acetyloxy-2-[[[(2R,3R,4R,5R)-5-(4-benzamido-2-oxopyrimidin-1-yl)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-2-[[(4-methoxyphenyl)-diphenylmethoxy]methyl]oxolan-3-yl]oxy-methoxyphosphoryl]oxymethyl]-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl] acetate
  参考文献：
  名称：

  A study on the alkylsilyl groups in oligoribonucleotide synthesis

  摘要：

  DOI：

  10.1021/jo00302a044
• 作为产物：
  描述：

  氯(二异丙基氨基)甲氧基膦 、 2-氨基-2-苯基丙酸盐酸盐 在 4-二甲氨基吡啶 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 3.0h， 以90%的产率得到N⁴-benzoyl-5'-O-(monomethoxytrityl)-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)cytidine 3'-N,N-diisopropylmethylphosphoramidite
  参考文献：
  名称：

  The automated chemical synthesis of long oligoribuncleotides using 2'-O-silylated ribonucleoside 3'-O-phosphoramidites on a controlled-pore glass support: synthesis of a 43-nucleotide sequence similar to the 3'-half molecule of an Escherichia coli formylmethionine tRNA

  摘要：

  DOI：

  10.1021/ja00259a037

文献信息

• Preparation of ribonucleoside 3′-O-phosphoramidites and their application to the automated solid phase synthesis of oligonucleotides
  作者：Nassim Usman、Richard T. Pon、Kelvin K. Ogilvie

  DOI：10.1016/s0040-4039(00)98753-7

  日期：1985.1
• WU, TAIFENG;OGILVIE, KELVIN K., J. ORG. CHEM., 55,(1990) N5, C. 4717-4724
  作者：WU, TAIFENG、OGILVIE, KELVIN K.

  DOI：——

  日期：——
• POMAHOBA, E. A.;ORETSKAYA, T. S.;SUXOMLINOV, V. V.;KRYNETSKAYA, N. F.;MET+, BIOORGAN. XIMIYA, 16,(1990) N0, S. 1348-1354
  作者：POMAHOBA, E. A.、ORETSKAYA, T. S.、SUXOMLINOV, V. V.、KRYNETSKAYA, N. F.、MET+

  DOI：——

  日期：——