5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-{[(triisopropylsilyl)oxy]methyl}guanosine | 312709-92-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-{[(triisopropylsilyl)oxy]methyl}guanosine
• 英文别名: 2-amino-9-[(2R,3R,4R,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-hydroxy-3-[tri(propan-2-yl)silyloxymethoxy]oxolan-2-yl]-1H-purin-6-one
• CAS: 312709-92-5
• 化学式: C₄₁H₅₃N₅O₈Si
• 分子量: 771.986
• InChiKey: SFUGLZCXCWSKSU-ZENBVRMOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.52
• 重原子数：
  55
• 可旋转键数：
  16
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.44
• 拓扑面积：
  161
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-{[(triisopropylsilyl)oxy]methyl}guanosine 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 Phenoxy-acetic acid (2R,3R,4R,5R)-2-[bis-(4-methoxy-phenyl)-phenyl-methoxymethyl]-5-[2-(2-phenoxy-acetylamino)-6-(2,4,6-trimethyl-benzenesulfonyloxy)-purin-9-yl]-4-triisopropylsilanyloxymethoxy-tetrahydro-furan-3-yl ester
  参考文献：
  名称：

  通过功能化的核碱基触发RNA二级结构。

  摘要：

  DOI：

  10.1002/anie.200460068
• 作为产物：
  描述：

  N²-acetyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-{[(triisopropylsilyl)oxy]methyl}guanosine 在 甲胺 作用下， 以 乙醇 为溶剂， 反应 1.0h， 以87%的产率得到5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-{[(triisopropylsilyl)oxy]methyl}guanosine
  参考文献：
  名称：

  用于合成 3'(2')-O-氨基酰化 RNA 序列的新型氟化物不稳定核碱基保护基团

  摘要：

  为了开发一种全合成氨酰化 t-RNA 和类似物的通用方法，我们描述了稳定的氨酰化 RNA 片段的合成，这些片段在连接后可能导致氨酰化 t-RNA 结构. 具有氟化物不稳定的 2'-O-[(三异丙基甲硅烷基)-氧基]甲基 (=tom) 糖保护和 N-{{2-[(三异丙基甲硅烷基)氧基]苄基}氧基}羰基 (=tboc) 碱基的新型 RNA 亚磷酰胺制备了-保护基团，以及固体支持物。具有正交（光不稳定）2'-O-[(S)-1-(2-硝基苯基)乙氧基]甲基 (=(S)-npeom) 基团的固定化 N6-tboc 保护腺苷。从这些构件中，制备了六聚体寡核糖核苷酸。通过标准下的自动合成。条件。脱离固体支撑物后，得到的完全受保护的序列用 L-苯丙氨酸衍生物氨基酰化。携带光不稳定的N-保护基团。在去除氟化物不稳定的糖和核碱基保护基团后，获得了仍然稳定的、部分用光不稳定基团保护的氨基酰化RNA序列的前体。温和条件下的光解导致

  DOI：

  10.1002/1522-2675(20000906)83:9<2477::aid-hlca2477>3.0.co;2-9

文献信息

• Synthesis of 2′-O-[(Triisopropylsilyl)oxy]methyl (= tom)-Protected Ribonucleoside Phosphoramidites Containing Various Nucleobase Analogues
  作者：Sébastien Porcher、Stefan Pitsch

  DOI：10.1002/hlca.200590209

  日期：2005.10

  new and shorter synthetic strategies, and sometimes introduced other nucleobase-protecting groups. The 2′-O-tom, 5′-O-(dimethoxytrityl)-protected ribonucleosides N2-acetylisocytidine 5, O2-(diphenylcarbamoyl)-N6-isobutyrylisoguanosine 8, N6-isobutyryl-N2-(methoxyacetyl)purine-2,6-diamine ribonucleoside (= N8-isobutyryl-2-[(methoxyacetyl)amino]adenosine) 11, 5-methyluridine 13, and 5,6-dihydrouridine 15

  报道了旨在有效制备多种2'- O -[（三异丙基甲硅烷基）氧基]甲基（＝ tom）保护的含有修饰的核碱基的核糖核苷亚磷酰胺结构单元的研究的第一结果。所有这里提出的核苷已经掺入到RNA序列通过其他几组，采用2'- ö -tbDMS-或2'- ø -汤姆保护的亚磷酰胺结构单元（TBDMS =（叔丁基）二甲基甲硅烷）。现在，我们优化了现有反应，开发了一些新的和较短的合成策略，有时还引入了其他核碱基保护基团。2'- ø -汤姆，5'- ø - （二甲氧基三苯甲基）保护的核糖核苷Ñ2-乙酰基异胞苷5，O 2-（二苯基氨基甲酰基）-N 6-异丁酰基异鸟苷8，N 6-异丁酰基-N 2-（甲氧基乙酰基）嘌呤-2,6-二胺核糖核苷（=  N 8-异丁酰基-2-[（甲氧基乙酰基）氨基]腺苷）11，5-甲基尿苷13，和5,6-二氢尿苷15通过首先引入核碱基保护基团和二甲氧基三苯甲基，分别，接着2'-制备ø -汤姆基（方案1）。另一个呈现2'-
• Chemical Approach for the Study of the ‘Kissing Complex’ of<i>Moloney murine leukaemia</i>Virus
  作者：Sébastien Porcher

  DOI：10.1002/hlca.200890133

  日期：2008.7

  The replication of Moloney murine leukaemia virus relies on the formation of a stable homodimeric ‘kissing complex’ of a GACG tetraloop interacting through only two C⋅G base pairs flanked of 5′-adjacent unpaired adenosines A9. Previous NMR investigations of a model stem loop 1 has not permitted to reveal the origin of this interaction. Therefore, with the aim of deeper comprehension of the phenomena

  莫洛尼氏鼠白血病病毒的复制依赖于稳定的同型二聚体“ kissing complex”（GACG四环）的形成，后者仅通过两个5'相邻的未配对腺苷A9旁侧的C⋅G碱基对相互作用。先前对模型茎环1的NMR研究不允许揭示这种相互作用的起源。因此，为了更深入地理解该现象，制备了模型序列10，其中位置9已被取代，从而提供了更宽的π堆积的核苷。在这种情况下，wyosine亚磷酰胺结构单元2通过适应自动合成的条件并开发原始的模板化酶促连接剂，制备并掺入了糖原。然而，由于空间位阻，未见该模型序列10的“亲吻相互作用”，如通过计算模拟所证实的。因此，制备了其他几个含有修饰核苷的模型序列18、23 – 26。最后，通过制备18mer RNA发夹27揭示了G8和G11核碱基之间的交叉环H键的重要性，其中鸟嘌呤G8已取代了肌苷。后者不具有C 3 与鸟嘌呤相比，氨基功能无法形成任何“亲吻复合物”，这表明这种次级相互作用在复合物形成中的重要性。