N(iPr)2P(OCH2CH2CN)(-3)[DMT(-5)]Ribf(b)-cytosin-1-yl | 948899-56-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: N(iPr)2P(OCH2CH2CN)(-3)[DMT(-5)]Ribf(b)-cytosin-1-yl
• 英文别名: 3-[[(2R,3S,4R,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-hydroxyoxolan-3-yl]oxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxypropanenitrile
• CAS: 948899-56-7
• 化学式: C₃₉H₄₈N₅O₈P
• 分子量: 745.813
• InChiKey: GQWKGJXXYGUKIU-DJTPZYMWSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4
• 重原子数：
  53
• 可旋转键数：
  17
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.41
• 拓扑面积：
  161
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-dimethoxytrityl-5-iodo-2'-deoxyuridine 3'-[(2-cyanoethyl)(N,N-diisopropyl)]phosphoramidite 、 N(iPr)2P(OCH2CH2CN)(-3)[DMT(-5)]Ribf(b)-cytosin-1-yl 、 (2R,3S,4R,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1,6-dihydro-9H-purin-9-yl)-2-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)-4-hydroxytetrahydrofuran-3-yl (2-cyanoethyl) diisopropylphosphoramidite 、 5’-(4,4’-二甲氧基三苯基)-3’-脱氧胸苷 2’-(2-氰乙基-N,N-二异丙基)亚磷酰胺 、 alkaline earth salt of/the/ methylsulfuric acid 生成 5'-d((trans-5-carboxyvinyl-2'-deoxyuridine)GCGTG)-3'
  参考文献：
  名称：

  Photochemical Site-specific Mutation of 5-Methylcytosine to Thymine

  摘要：

  在这项研究中，我们报道了 5-甲基胞嘧啶与 5-氨基甲酰基乙烯基-脱氧尿苷介导的光连接的偶联引起了热诱导的从 5-甲基胞嘧啶到胸腺嘧啶的转变。 5-甲基胞嘧啶脱氨基为胸腺嘧啶通过环丁烷二聚体的形成进行。

  DOI：

  10.1246/cl.2008.94

文献信息

• METHOD FOR DETACHING PROTECTING GROUP ON NUCLEIC ACID
  申请人：Shiba Yoshinobu

  公开号：US20090149645A1

  公开（公告）日：2009-06-11

  A method is provided for removing a 2-cyanoethoxymethyl (CEM) group and substituting the 2′-hydroxyl group of each ribose of an oligonucleic acid derivative with good reproducibility and high efficiency.

  提供了一种方法，用于去除2-氰乙氧甲基（CEM）基团，并将寡核苷酸衍生物的每个核糖的2'-羟基以良好的可重复性和高效率进行置换。
• US8158775B2
  申请人：——

  公开号：US8158775B2

  公开（公告）日：2012-04-17
• Photochemical Site-specific Mutation of 5-Methylcytosine to Thymine
  作者：Takashi Matsumura、Masayuki Ogino、Kango Nagayoshi、Kenzo Fujimoto

  DOI：10.1246/cl.2008.94

  日期：2008.1.5

  In this study, we report that the coupling of 5-methylcytosine with 5-carbamoylvinyl-deoxyuridine-mediated photoligation caused the heat-induced transition from 5-methylcytosine to thymine. Deamination of 5-methylcytosine to thymine proceeded via the formation of cyclobutane dimer.

  在这项研究中，我们报道了 5-甲基胞嘧啶与 5-氨基甲酰基乙烯基-脱氧尿苷介导的光连接的偶联引起了热诱导的从 5-甲基胞嘧啶到胸腺嘧啶的转变。 5-甲基胞嘧啶脱氨基为胸腺嘧啶通过环丁烷二聚体的形成进行。