cis-[Pd(ethylenediamine)(D2O)2](2+) | 76601-55-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机盐 - 有机金属盐
• 英文名称: cis-[Pd(ethylenediamine)(D2O)2](2+)
• 英文别名: Pd(water-d2)2(ethylenediamine)(2+)；[Pd(ethylenediamine)(D2O)2](2+)；cis-[Pd(en)(D2O)2](2+)；[Pd(en)(D2O)2](2+)；Pd(D2O)2(en)(2+)
• CAS: 76601-55-3
• 化学式: C₂H₁₂N₂O₂Pd
• 分子量: 206.518
• InChiKey: UYYZSMXGUKHEFE-JBISRTOLSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  None
• 重原子数：
  None
• 可旋转键数：
  None
• 环数：
  None
• sp3杂化的碳原子比例：
  None
• 拓扑面积：
  None
• 氢给体数：
  None
• 氢受体数：
  None

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  cis-[Pd(ethylenediamine)(D2O)2](2+) 、 CH3CO-CysMe-His-GlyH 以 重水 为溶剂， 生成 Pd(CH3CO-CysMe-His-GlyH)(2+)
  参考文献：
  名称：

  钯介导的细胞色素c：1 H NMR中His18–Thr19肽键选择性水解的新见解和模型化合物的密度泛函理论研究

  摘要：

  这 肽，CH 3 CO-Met-His-GlyH，CH 3 CO-CysMe-His-GlyH，CH 3 CO-CysMe-His-Gly-OEt及其咪唑衍生物，Ñ τ -苄基，Ñ τ甲苯磺酰，Ñ τ苄基Ñ π -phenacyl，已被合成，并用作模型化合物为选择性裂解的机理研究细胞色素c由Pd（II）配合物促进。这肽这些底物的键裂解由顺- [钯（烯）（溶剂）2 ] 2+ （溶剂：D 2 O或CD 3 OD）由1 H NMR光谱。结果表明蛋氨酸含 三肽不同于含S-甲基半胱氨酸三肽以与Pd（II）协调的方式。前者通过硫原子与Pd（II）配位，酰胺 氮 的 蛋氨酸和Ñ π的原子咪唑，形成多环螯合物，并且对 水解。后者，作为裂解His18–Thr19键的模型化合物细胞色素c用Pd（II）络合物，坐标的Pd（II） 经由硫原子，一个酰胺 氮 和一个 羰 氧气 组氨酸 形成多环螯合物，其中His-Gly

  DOI：

  10.1039/b211882c
• 作为产物：
  描述：

  乙二胺氯化钯(II) 、 重水 在 AgBF₄ 作用下， 以 重水 为溶剂， 生成 cis-[Pd(ethylenediamine)(D2O)2](2+)
  参考文献：
  名称：

  钯介导的细胞色素c：1 H NMR中His18–Thr19肽键选择性水解的新见解和模型化合物的密度泛函理论研究

  摘要：

  这 肽，CH 3 CO-Met-His-GlyH，CH 3 CO-CysMe-His-GlyH，CH 3 CO-CysMe-His-Gly-OEt及其咪唑衍生物，Ñ τ -苄基，Ñ τ甲苯磺酰，Ñ τ苄基Ñ π -phenacyl，已被合成，并用作模型化合物为选择性裂解的机理研究细胞色素c由Pd（II）配合物促进。这肽这些底物的键裂解由顺- [钯（烯）（溶剂）2 ] 2+ （溶剂：D 2 O或CD 3 OD）由1 H NMR光谱。结果表明蛋氨酸含 三肽不同于含S-甲基半胱氨酸三肽以与Pd（II）协调的方式。前者通过硫原子与Pd（II）配位，酰胺 氮 的 蛋氨酸和Ñ π的原子咪唑，形成多环螯合物，并且对 水解。后者，作为裂解His18–Thr19键的模型化合物细胞色素c用Pd（II）络合物，坐标的Pd（II） 经由硫原子，一个酰胺 氮 和一个 羰 氧气 组氨酸 形成多环螯合物，其中His-Gly

  DOI：

  10.1039/b211882c

文献信息

• Different Rotamer States of Cytosine Nucleobases in Heteronuclear PtPd-, PtPd₂, and Pt₂Pd₂Ag Complexes Derived from [Pt(2,2′-bpy)(1-MeC-<i>N3</i>)₂]²⁺ (1-MeC = 1-Methylcytosine): First Examples of Species with Head–Head Oriented 1-MeC^– Ligands
  作者：Lu Yin、Pablo J. Sanz Miguel、Wolf Hiller、Bernhard Lippert

  DOI：10.1021/ic3005097

  日期：2012.6.18

  Nevertheless, 1 reacts with (en)PdII (en = ethylenediamine) to give preferentially the dinuclear complex [Pt(2,2′-bpy)(1-MeC–-N3,N4)2Pd(en)](NO3)2·5H2O (2) with head–head arranged 1-methylctosinato (1-MeC–) ligands and Pd being coordinated to two exocyclic N4H– positions. Addition of AgNO3 to a solution of 2 leads to formation of a pentanuclear chain compound [Pt(2,2′-bpy)(1-MeC–)2Pd(en)}2Ag](NO3)5·14H2O (5)

  [PT（2,2'-bpy）（1-MEC- N3）2 ]（NO 3）2（1）（2,2'-bpy = 2,2'-联吡啶; 1-MEC = 1-甲基胞嘧啶）存在于水中的头尾和头顶旋转的平衡，前者超过后者约一个系数。在室温下为20。然而，1种发生反应与（烯）钯II（EN =乙二胺），得到优先的双核配合物[PT（2,2'-联吡啶）（1-MEC - - N3，N4）2的Pd（烯）]（NO 3）2 ·5H 2 O（2），头顶排列成1-甲基邻氨基苯并（1-MEC –）配体和Pd配位至两个环外N4H –位置。在2的溶液中添加AgNO 3导致形成五核链化合物[PT（2,2'-bpy）（1-MEC –）2 Pd（en）} 2 Ag]（NO 3）5 ·14H 2 O（5），其中的Ag +交联的两种阳离子2经由1-MEC的四个可用O2位点-配体。图2和5似乎是衍生自PT II的双核和多核复合物的第一个X射线结构表
• A study of the reactions of a methionine- and histidine-containing tetrapeptide with different Pd(ii) and Pt(ii) complexes: selective cleavage of the amide bond by platination of the peptide and steric modification of the catalyst
  作者：Snežana Rajković、Marija D. Živković、Csilla Kállay、Imre Sóvágó、Miloš I. Djuran

  DOI：10.1039/b908182h

  日期：——

  (1)H NMR spectroscopy was applied to the study of the reactions of [M(en)(H(2)O)(2)](2+) complexes (M = Pd(ii) and Pt(ii)) with the N-acetylated methionyl-glycyl-histidyl-glycineamide, MeCOMet-Gly-His-GlyNH(2). All reactions were performed in the pH range 1.5-2.0 with equimolar amounts of the [M(en)(H(2)O)(2)](2+) complex and the tetrapeptide at 60 degrees C. In all these reactions, a metal(ii) complex

  （1）H NMR光谱用于研究[M（en）（H（2）O）（2）]（2+）配合物（M = Pd（ii）和Pt（ii））与N-乙酰化的甲硫酰基-甘氨酰-组氨酸-甘氨酰胺，MeCOMet-Gly-His-GlyNH（2）。所有反应均在60℃下于1.5-2.0 pH范围内用等摩尔量的[M（en）（H（2）O）（2）]（2+）配合物和四肽进行。与甲硫氨酸残基结合的金属（ii）配合物影响涉及甲硫氨酸羧基的酰胺键的区域选择性裂解。与该肽中的其他酰胺键相比，Met-Gly酰胺键的切割优先级归因于Pt（ii）和Pd（ii）离子对硫供体原子的高度亲和力。讨论了这些水解反应的机理，并为澄清起见，[Pd（en）（H（2）O）（2）]（2+）配合物与MeCOMet-Gly-His-GlyNH（2）的反应还通过电位滴定法进行了研究。[Pd（L）（H（2）O）（2）]（2+）类型的各种钯（ii）配合物的空间效应，其中L是
• Structural and Kinetic Studies on the Formation of Platinum(II) and Palladium(II) Complexes with <scp>l</scp>-Cysteine-Derived Ligands
  作者：Tobias Rau、Ralf Alsfasser、Achim Zahl、Rudi van Eldik

  DOI：10.1021/ic9711574

  日期：1998.8.1

  (py-CH(2)-accys) and (alpha)N-acetyl-S-ethylene-2-(2'-pyridine)-L-cysteine (py-C(2)H(4)-accys) with [Pt(en)(H(2)O)(2)](2+) and [Pd(en)(H(2)O)(2)](2+) were investigated structurally by NMR spectroscopy and kinetically by UV-vis and stopped-flow spectrophotometry. The complexes [Pt(en)(py-CH(2)-accys-S,N)](NO(3))(2) (1) and [Pt(en)(py-C(2)H(4)-accys-S,N)](NO(3))(2) (2) were isolated and purified by reversed-phase

  L-半胱氨酸衍生的配体（α）N-乙酰基-S-亚甲基-（2'-吡啶）-L-半胱氨酸（py-CH（2）-accys）和（α）N-乙酰基的复杂形成反应-S-乙烯-2-（2'-吡啶）-L-半胱氨酸（py-C（2）H（4）-accys）具有[Pt（en）（H（2）O）（2）]（2 +）和[Pd（en）（H（2）O）（2）]（2+）在结构上通过NMR光谱进行了研究，在动力学上通过UV-vis和停流分光光度法进行了研究。络合物[Pt（en）（py-CH（2）-accys-S，N）] [NO（3））（2）（1）和[Pt（en）（py-C（2）H（4） ）-accys-S，N）]（NO（3））（2）（2）分离并通过反相HPLC纯化。NMR光谱显示1和2及其Pd（II）类似物3和4具有五元和六元螯合环的S-硫醚，N-吡啶基螯合模式。氨基酸官能团不参与配位。复杂形成反应的二级速率常数的比较导致py-CH（2）-accys的k（Pd（II））/
• Exploring the Metal Coordination Properties of the Pyrimidine Part of Purine Nucleobases: Isomerization Reactions in Heteronuclear Pt^II/Pd^II of 9-Methyladenine
  作者：Susana Ibáñez、Francisca M. Albertí、Pablo J. Sanz Miguel、Bernhard Lippert

  DOI：10.1021/ic201548k

  日期：2011.10.17

  The synthesis and characterization of three nuclear Pt2Pd2 (4, 5) and PtPd2 (6) complexes of the model nucleobase 9-methyladenine (9-MeA) is reported. The compounds were prepared by reacting [Pt(NH3)(3)(9-MeA-N7)] (ClO)(2) (1) with [Pd(en)(H2O)(2)](ClO4)(2) at different ratios r between Pt and Pd, with the goal to probe Pd-II binding to any of the three available nitrogen atoms, N1, N3, N6 or combinations thereof. Pd-II coordination occurs at N1 and at the deprotonated N6 positions, yet not at N3. 4 and 5 are isomers of [(en)Pd}(2)N1,N6-9-MeA(-)-N7)Pt(NH3)(3)}(2)](ClO4)(6)center dot nH(2)O, with a head head orientation of the two bridging 9-MeA(-) ligands in 4 and a head tail orientation in 5.6 is [(en)Pd}(2)(OH)(N1,N6-9MeA(-)-N7)Pt(NH3)(3)] (ClO4)(4)center dot 4H(2)O, hence a the N1 and N6 positions of 9-MeA(-) in an intramolecular fashion. 4 and 5, which slowly interconvert in aqueous solution, display distinct structural differences such as significantly different intramolecular Pd center dot center dot center dot Pd contacts (3.124 0(16) angstrom in 4; 2.986 6(14) angstrom in 5), among others. Binding of (en)Pd-II to the exocyclic N6 atom in 4 and 5 is accompanied by a large movement of Pdu out of the 9-MeA(-) plane and a trend to a further shortening of the C6-N6 bond as compared to free 9-MeA. The packing patterns of 4 and 5 reveal substantial anion-pi interactions.