5'-S-acetyl-N4-benzoyl-2',3'-O-isopropylidene-6-{[(4-methoxyphenyl)(diphenyl)methoxy]methyl}-5'-thiocytidine | 1309371-95-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-S-acetyl-N4-benzoyl-2',3'-O-isopropylidene-6-{[(4-methoxyphenyl)(diphenyl)methoxy]methyl}-5'-thiocytidine
• CAS: 1309371-95-6
• 化学式: C₄₂H₄₁N₃O₈S
• 分子量: 747.869
• InChiKey: SJYGVDJJUDYDTK-CBOKRJPRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.71
• 重原子数：
  54.0
• 可旋转键数：
  12.0
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.29
• 拓扑面积：
  127.21
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  11.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-S-acetyl-N4-benzoyl-2',3'-O-isopropylidene-6-{[(4-methoxyphenyl)(diphenyl)methoxy]methyl}-5'-thiocytidine 在 甲醇 、 potassium carbonate 作用下， 反应 0.17h， 生成
  参考文献：
  名称：

  具有整合的碱基和骨干的寡核苷酸类似物。第27章

  摘要：

  （氯甲基）胞嘧啶核苷7是从醇4中获得的，该醇是通过C（6）-甲酰化和还原反应从受保护的胞苷3合成的。硫代乙酸酯10从胞苷得到2，和硫代乙酸酯8从光延醇的反应6。硫亚甲基连接的二核苷11是由6-（氯甲基）胞苷7与硫胞苷5'-硫代乙酸酯10的S-去乙酰化和N-去苯甲酰化生成的硫醇盐合成的。二核苷11被甲硅烷基化为12，并完全脱保护为13。与11相似，C（6）取代的类似物14是从7和C（6）取代的8获得的。的逐步脱保护14提供15 - 17，并完成脱保护以得到18。硫代乙酰化和N-苯甲酰化的二核苷21是从甲磺酸9和硫代乙酸8生成的硫醇获得的。同样，7和8产生19转化为甲磺酸20。由甲磺酸盐20和衍生自21的硫醇合成四核苷23。将其脱苯甲酰化为23，并完全脱保护为24。

  DOI：

  10.1002/hlca.201000451
• 作为产物：
  描述：

  N4-benzoyl-5'-O-[dimethyl(1,1,2-trimethylpropyl)silyl]-2',3'-O-isopropylidenecytidine 在 4-二甲氨基吡啶 、 sodium tetrahydroborate 、 偶氮二甲酸二异丙酯 、 triethylamine tris(hydrogen fluoride) 、 N,N-二异丙基乙胺 、 三苯基膦 、 lithium diisopropyl amide 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 28.17h， 生成 5'-S-acetyl-N4-benzoyl-2',3'-O-isopropylidene-6-{[(4-methoxyphenyl)(diphenyl)methoxy]methyl}-5'-thiocytidine
  参考文献：
  名称：

  具有整合的碱基和骨干的寡核苷酸类似物。第27章

  摘要：

  （氯甲基）胞嘧啶核苷7是从醇4中获得的，该醇是通过C（6）-甲酰化和还原反应从受保护的胞苷3合成的。硫代乙酸酯10从胞苷得到2，和硫代乙酸酯8从光延醇的反应6。硫亚甲基连接的二核苷11是由6-（氯甲基）胞苷7与硫胞苷5'-硫代乙酸酯10的S-去乙酰化和N-去苯甲酰化生成的硫醇盐合成的。二核苷11被甲硅烷基化为12，并完全脱保护为13。与11相似，C（6）取代的类似物14是从7和C（6）取代的8获得的。的逐步脱保护14提供15 - 17，并完成脱保护以得到18。硫代乙酰化和N-苯甲酰化的二核苷21是从甲磺酸9和硫代乙酸8生成的硫醇获得的。同样，7和8产生19转化为甲磺酸20。由甲磺酸盐20和衍生自21的硫醇合成四核苷23。将其脱苯甲酰化为23，并完全脱保护为24。

  DOI：

  10.1002/hlca.201000451

文献信息

• Oligonucleotide Analogues with Integrated Bases and Backbone. Part 30
  作者：Lorenz Herdeis、Siji Thomas、Bruno Bernet、Andrea Vasella

  DOI：10.1002/hlca.201300043

  日期：2013.7

  The protected G*[s]C*[s]U*[s]A*[s]U*[s]A*[s]G*[s]C* octanucleoside 24 was prepared by S‐alkylation of the thiolate derived from tetranucleoside 23 with the methanesulfonate 22, and transformed to the silylated and isopropylidenated 25, and further into the fully deprotected octanucleoside 26. Compound 22 was derived from the methoxytrityl‐protected tetranucleoside 21, and 21 was obtained by S‐alkylation

  受保护的G * [ s ] C * [ s ] U * [ s ] A * [ s ] U * [ s ] A * [ s ] G * [ s ] C *八核苷24是通过硫醇盐的S烷基化制备的衍生自四核苷23与甲磺酸盐22，并转化为甲硅烷基化和异丙基亚甲基25，进一步转化为完全脱保护的八核苷26。化合物22衍生自甲氧基三苯甲基保护的四核苷21，通过S获得21通过去三苯甲基化和甲磺酰化作用，将由二核苷19衍生的硫醇盐与由16衍生的甲磺酸盐17进行烷基化。同样，四核苷23是由18衍生的硫醇盐与19衍生的甲磺酸盐20的S烷基化产生的。二核苷16和18是由已知的胞苷衍生的硫代乙酸盐15与C（8）取代的鸟苷衍生的甲磺酸盐12和14衍生的硫醇盐的S烷基化产生的。它们分别通过甲酰化，还原，保护和甲磺酰化作用从受保护的前体4和7合成。