5'-O-dimethoxytrityl-N,N'-bis(trifluoroacetyl)putrescinylthymidine | 90289-37-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-dimethoxytrityl-N,N'-bis(trifluoroacetyl)putrescinylthymidine
• 英文别名: N-[4-[[1-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]-2,4-dioxopyrimidin-5-yl]methyl-(2,2,2-trifluoroacetyl)amino]butyl]-2,2,2-trifluoroacetamide
• CAS: 90289-37-5
• 化学式: C₃₉H₄₀F₆N₄O₉
• 分子量: 822.758
• InChiKey: IFJRTQFTKGTBSC-DCMFLLSESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.56
• 重原子数：
  58.0
• 可旋转键数：
  16.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  161.42
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  10.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-dimethoxytrityl-N,N'-bis(trifluoroacetyl)putrescinylthymidine 在 N-甲基咪唑 作用下， 以 吡啶 为溶剂， 反应 6.0h， 生成 triethylammonium 5'-O-dimethoxytrityl-N,N'-bis(trifluoroacetyl)putrescinylthymidine 3'-(4-chlorophenyl)phosphate
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and properties of deoxyoligonucleotides containing putrescinylthymine (nucleosides and nucleotides. LXXVI).

  摘要：

  腐胺胸苷是通过从 2'-脱氧-5-甲酰尿苷衍生物和 N-邻苯二甲酰胺腐胺形成的希夫碱的还原反应制备的，随后进行去保护处理。合成了以下含有腐胺胸苷（TP）的脱氧寡核苷酸；含有两个到四个 TP 殘基的十二聚胸苷酸、自互补的十聚核苷酸（AAGAATTCTT）和十二聚核苷酸（AGATAGCTATCT），其中 T 残基部分被 TP 替代，以及相关的寡聚物。含有 TP 的寡核苷酸对核酸酶 S1 消化具抵抗性，并且是毒液磷酸二酯酶的劣质底物。尽管预计腐胺和磷酸残基之间存在静电结合，含有 TP 的寡聚物双链结构的热稳定性（Tm）并没有增强，而是相当依赖序列。

  DOI：

  10.1248/cpb.35.3558
• 作为产物：
  描述：

  4,4'-双甲氧基三苯甲基氯 、 N,N'-bis(trifluoroacetyl)putrescinylthymidine 生成 5'-O-dimethoxytrityl-N,N'-bis(trifluoroacetyl)putrescinylthymidine
  参考文献：
  名称：

  TAKEDA, TADAYUKI;IKEDA, KAZUYOSHI;MIZUNO, YOSHIHISA;UEDA, TOHRU, CHEM. AND PHARM. BULL., 35,(1987) N 9, 3558-3567

  摘要：

  DOI：