5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-4'-C-methoxymethylen-3'-O-phenoxyacetylene thymidine | 950685-74-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-4'-C-methoxymethylen-3'-O-phenoxyacetylene thymidine
• CAS: 950685-74-2
• 化学式: C₄₁H₄₂N₂O₁₀
• 分子量: 722.792
• InChiKey: JVALBHLLSOJGGI-ATJNRAPGSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.17
• 重原子数：
  53.0
• 可旋转键数：
  15.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.29
• 拓扑面积：
  136.54
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  11.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-4'-C-methoxymethylen-3'-O-phenoxyacetylene thymidine 在 1-甲基吡咯烷 、 4-二甲氨基吡啶 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 7.0h， 生成 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-4'-C-methoxymethylen-3'-phenoxyacetylen-4-S-(2-cyanoethyl)thiothymidine
  参考文献：
  名称：

  通过带有核碱基和2'-脱氧核糖修饰的引物探针，在等位基因特异性聚合酶链反应中增加单核苷酸区分度。

  摘要：

  由于发现这些变异与复杂表型（如某些疾病的易感性或与药物的相容性）有关，因此个体之间遗传差异的诊断变得越来越重要。这些序列变异中最常见的是单核苷酸多态性（SNP）。可靠而有效的方法用于审问各自的基因型，是沿这些方向发展的基础。存在许多用于检测基因中核苷酸变异的方法，其中在进行分析之前需要扩增靶基因。等位基因特异性聚合酶链反应（asPCR）在一个步骤中结合了靶标扩增和分析。asPCR的原理基于匹配或不匹配的引物-靶标复合物的形成。asPCR中最重要的参数是对这些匹配或不匹配对的区分。在最近的出版物中，我们表明通过使用化学修饰的引物探针可以提高通过asPCR进行SNP检测的可靠性。特别地，在3'末端带有极性4'-C-甲氧基亚甲基残基的引物探针在通过PCR区分单核苷酸变异方面具有优异的特性。在这里，我们描述了几种引物的合成，这些探针除4'-C-甲氧基甲基化的2'-脱氧核糖外还带有核碱基修饰。我们在

  DOI：

  10.1002/chem.200601627
• 作为产物：
  描述：

  苯氧基乙酸酐 、 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-4'-C-methoxymethylenethymidine 在 4-二甲氨基吡啶 作用下， 以 吡啶 为溶剂， 反应 48.0h， 以95%的产率得到5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-4'-C-methoxymethylen-3'-O-phenoxyacetylene thymidine
  参考文献：
  名称：

  通过带有核碱基和2'-脱氧核糖修饰的引物探针，在等位基因特异性聚合酶链反应中增加单核苷酸区分度。

  摘要：

  由于发现这些变异与复杂表型（如某些疾病的易感性或与药物的相容性）有关，因此个体之间遗传差异的诊断变得越来越重要。这些序列变异中最常见的是单核苷酸多态性（SNP）。可靠而有效的方法用于审问各自的基因型，是沿这些方向发展的基础。存在许多用于检测基因中核苷酸变异的方法，其中在进行分析之前需要扩增靶基因。等位基因特异性聚合酶链反应（asPCR）在一个步骤中结合了靶标扩增和分析。asPCR的原理基于匹配或不匹配的引物-靶标复合物的形成。asPCR中最重要的参数是对这些匹配或不匹配对的区分。在最近的出版物中，我们表明通过使用化学修饰的引物探针可以提高通过asPCR进行SNP检测的可靠性。特别地，在3'末端带有极性4'-C-甲氧基亚甲基残基的引物探针在通过PCR区分单核苷酸变异方面具有优异的特性。在这里，我们描述了几种引物的合成，这些探针除4'-C-甲氧基甲基化的2'-脱氧核糖外还带有核碱基修饰。我们在

  DOI：

  10.1002/chem.200601627