N6-Benzoyl-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)adenosin-3'-(o-chlorphenyl)(β-cyanethyl)phosphat | 75074-02-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 核糖核苷3'-磷酸盐
• 英文名称: N6-Benzoyl-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)adenosin-3'-(o-chlorphenyl)(β-cyanethyl)phosphat
• 英文别名: N⁶-Benzoyl-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)adenosin-3'-(o-chlorphenyl)(β-cyanethyl)phosphat；N⁶-Benzoyl-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)adenosin-3'-(2-chlorophenyl)(2-cyanaethyl)phosphat；N⁶-Benzoyl-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)adenosin-3'-(2-chlorphenyl)(2-cyanaethyl)phosphat
• CAS: 75074-02-1
• 化学式: C₃₂H₃₈ClN₆O₈PSi
• 分子量: 729.201
• InChiKey: YJRADAQOCXVSCO-NMMXYLOLSA-N

物化性质

• 密度：
  1.39±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.51
• 重原子数：
  49.0
• 可旋转键数：
  13.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.41
• 拓扑面积：
  179.94
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  13.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N6-Benzoyl-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)adenosin-3'-(o-chlorphenyl)(β-cyanethyl)phosphat 、 Triaethylammonium-(2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-5'-O-(4-methoxytrityl)-5,6-dihydrouridin-3'-(2-chlorophenyl)phosphat) 在 mesitylenesulfonic acid nitroimidazolide 作用下， 以 吡啶 为溶剂， 反应 72.0h， 以92%的产率得到2'-O-(tert-Butyldimethylsilyl)-5'-O-(4-methoxytrityl)-5,6-dihydrouridyl-(3'-(O^P-(2-chlorophenyl))-5')-N⁶-benzoyl-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)adenosin-3'-(2-chlorophenyl)(2-cyanaethyl)phosphat
  参考文献：
  名称：

  核苷酸，XXI。合成和本征化学二氢尿素-哈尔替勒寡核苷酸†

  摘要：

  核苷酸，XXI。含二氢尿苷的寡核苷酸的合成与性能

  DOI：

  10.1002/hlca.19830660832
• 作为产物：
  描述：

  叔丁基二甲基氯硅烷 在 咪唑 、 三氟乙酸 作用下， 以 吡啶 、 氯仿 为溶剂， 生成 N6-Benzoyl-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)adenosin-3'-(o-chlorphenyl)(β-cyanethyl)phosphat
  参考文献：
  名称：

  腺苷酸三聚体A2'p5'A2'p5'A，A2'p5'A3'p5'A和A3'p5'A2'p5'A的合成和性质

  摘要：

  分别具有（2'-5'）（2'-5'）和混合（2'-5'）（3'-5'）和（3'-5'）（2'-5'）键的三腺苷酸分别为通过磷酸三酯方法合成，然后解封完全保护的中间体。异构体三聚体通过NMR和CD光谱表征，并显示出非常相似的减色效应。

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(00)93649-9

文献信息

• Design, synthesis and systematic evaluation of all possible cyclic dinucleotides (CDNs) that activate human stimulator of interferon genes (STING) variants
  作者：Zheng-Hua Wang、Can-Can Zhao、Qiang-Zhe Zhang、Chuan-Lin Wang、Hang Zhang、De-Jun Ma、Da-Wei Wang、Xin Wen、Lu-Yuan Li、Zhen Xi

  DOI：10.1007/s11426-019-9662-5

  日期：2020.4

  activate stimulator of interferon genes (STING) and induce type I interferon responses, therefor possess great potentials to be of immunotherapeutic value for cancers and infectious diseases. However, the existence of different single nucleotide polymorphism (SNP) of human STING (hSTING) gene poses an obstacle to achieve broad-spectrum activation by CDNs. We reported here the design and synthesis of a

  摘要 已知环二核苷酸（CDN）可激活干扰素基因的刺激物（STING）并诱导I型干扰素应答，因此具有巨大的潜力，对癌症和传染病具有免疫治疗价值。然而，人类STING（hSTING）基因的不同单核苷酸多态性（SNP）的存在构成了通过CDN实现广谱激活的障碍。我们在这里报告了总共36个CDN的设计和合成，这些CDN代表所有结构变异，其中包含四个碱基（A，G，C，U）和两个链接方向（2'-5'-链接和3'-5'） -连接的磷酸二酯）。通过双萤光素酶报告基因检测系统评估IFN-β诱导，我们发现野生型hSTING和两个同工型（HAQ和AQ）表现出强烈的反应，而hSTING-R232H和R293Q表现出对CDNs刺激的相对较弱的反应。首次，我们发现c [G（2'，5'）U（2'，5'）]对所有五个hSTING变体均表现出优异的活性，甚至等同于内源性配体c [G（2'，5 ′）A（3′，5′）]。此外，我
• 制备化合物的方法
  申请人：南开大学

  公开号：CN110272462B

  公开（公告）日：2023-03-10

  本发明涉及化合物合成方法的改进领域，公开了一种制备化合物的方法。该方法包括：使式(I)、式(II)或式(III)所示线性化合物进行偶联反应，本发明公开的制备环二核苷酸及其类似物的方法具有高效、易操作、条件温和、低成本的优点。
• Nucleotide. XV. Synthese und Eigenschaften von 2?-O-t-Butyldimethylsilyl-5?-O-monomethoxytritylribonucleosid-3?-phosphotriestern, Ausgangssubstanzen f�r Oligonucleotid-Synthesen
  作者：Gunter Silber、Dieter Flockerzi、Rajendra Singh Varma、Ramamurthy Charubala、Eugen Uhlmann、Wolfgang Pfleiderer

  DOI：10.1002/hlca.19810640548

  日期：1981.7.22

  Nucleotides. XV. Synthesis and Properties of 2′O-t-Butyldimethylsilyl-5′-O-monomethoxytritylribonucleoside-3′-phosphotriesters, Starting Materials for Oligonucleotide Syntheses

  核苷酸。XV。合成及2个属性“ Ø -牛逼丁基二甲硅烷-5' Ø -monomethoxytritylribonucleoside-3'磷酸三酯，起始材料合成寡核苷酸
• Nucleotide, XVIII. Synthese und Eigenschaften von (tert-Butyldimethylsilyl)guanosinen, Guanosin-3?-phosphotriestern und Guanosin-haltigen Oligoncleotiden
  作者：Dieter Flockerzi、Wilhelm Schlosser、Wolfgang Pfleiderer

  DOI：10.1002/hlca.19830660718

  日期：1983.11.2

  Nucleotides, XVIII. Synthesis and Properties of (tert-Butyldimethylsilyl)guanosines, Guanosine-3′-Phosphotriesters and Guanosine-containing Oligonucleotides

  核苷酸，十八。（叔丁基二甲基甲硅烷基）鸟苷，鸟苷-3'-磷酸三酯和含鸟苷的寡核苷酸的合成及性能
• Nucleotide, XVII. Synthese von homogenen Adenosyl-3?,5?-Oligomeren nach dem Phosphotriester-Verfahren
  作者：Dieter Flockerzi、Eugen Uhlmann、Wolfgang Pfleiderer

  DOI：10.1002/hlca.19830660713

  日期：1983.11.2

  Nucleotides, XVII. Synthesis of Homogeneous Adenosyl-3′,5′-oligomers by the Phosphotriester Method

  核苷酸，十七。磷酸三酯法合成均相腺苷3'，5'-低聚物