4-[[2,5-dimethoxy-4-[(1,3,3-trimethyl-2-methylideneindol-5-yl)diazenyl]phenyl]diazenyl]-N-(6-hydroxyhexyl)benzamide | 1309374-49-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 偶氮苯
• 英文名称: 4-[[2,5-dimethoxy-4-[(1,3,3-trimethyl-2-methylideneindol-5-yl)diazenyl]phenyl]diazenyl]-N-(6-hydroxyhexyl)benzamide
• CAS: 1309374-49-9
• 化学式: C₃₃H₄₀N₆O₄
• 分子量: 584.718
• InChiKey: VMASGGTUIDABLW-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.9
• 重原子数：
  43
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  121
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-[[2,5-dimethoxy-4-[(1,3,3-trimethyl-2-methylideneindol-5-yl)diazenyl]phenyl]diazenyl]-N-(6-hydroxyhexyl)benzamide 、 2-氰乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 1.25h， 以40%的产率得到N-[6-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxyhexyl]-4-[[2,5-dimethoxy-4-[(1,3,3-trimethyl-2-methylideneindol-5-yl)diazenyl]phenyl]diazenyl]benzamide
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of novel azo-dyes and their use in oligonucleotide synthesis

  摘要：

  这项发明提供了一种新型的偶氮熄灭剂组合物，可用作荧光熄灭剂，并提供了制备和使用它们的方法。这些熄灭剂含有偶氮键和1,3,3-三甲基-2-亚甲基吲哚环系统。这些熄灭剂可以被衍生化，以便将它们与各种生物相关化合物（包括脂质、核酸、肽、蛋白质等）结合。

  公开号：

  US07956169B1
• 作为产物：
  描述：

  2,5-二甲氧基苯胺 在 sodium carbonate 、 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 、 sodium nitrite 作用下， 以 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 12.0h， 生成 4-[[2,5-dimethoxy-4-[(1,3,3-trimethyl-2-methylideneindol-5-yl)diazenyl]phenyl]diazenyl]-N-(6-hydroxyhexyl)benzamide
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of novel azo-dyes and their use in oligonucleotide synthesis

  摘要：

  这项发明提供了一种新型的偶氮熄灭剂组合物，可用作荧光熄灭剂，并提供了制备和使用它们的方法。这些熄灭剂含有偶氮键和1,3,3-三甲基-2-亚甲基吲哚环系统。这些熄灭剂可以被衍生化，以便将它们与各种生物相关化合物（包括脂质、核酸、肽、蛋白质等）结合。

  公开号：

  US07956169B1

文献信息

• Synthesis of novel azo-dyes and their use in oligonucleotide synthesis
  申请人：Chemgenes Corporation

  公开号：EP2397464B1

  公开（公告）日：2016-12-14