3-(2-deoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)-6-pentyn-1-yl-furo[2,3-d]pyrimidin-3H-2-one | 331242-93-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 呋喃[2,3-d]嘧啶
• 英文名称: 3-(2-deoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)-6-pentyn-1-yl-furo[2,3-d]pyrimidin-3H-2-one
• 英文别名: 3-(4-Hydroxy-5-hydroxymethyl-tetrahydro-furan-2-yl)-6-pent-4-ynyl-3H-furo[2,3-d]pyrimidin-2-one；3-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-6-pent-4-ynylfuro[2,3-d]pyrimidin-2-one
• CAS: 331242-93-4
• 化学式: C₁₆H₁₈N₂O₅
• 分子量: 318.329
• InChiKey: YSAKIJWBMZQQHD-BFHYXJOUSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.7
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  91.6
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-(2-deoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)-6-pentyn-1-yl-furo[2,3-d]pyrimidin-3H-2-one 在 ammonium hydroxide 作用下， 以92%的产率得到3-(2-deoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)-3,7-dihydro-6-pentyn-1-yl-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-2-one
  参考文献：
  名称：

  1，N 6 -Etheno-2'-deoxytubercidin和pyrrolo-C：7-脱氮嘌呤核苷和寡核苷酸的合成，碱基配对和荧光性质

  摘要：

  描述了由7-脱氮基2'-脱氧腺苷（5a）与氯乙醛合成的1，N 6-乙炔基-7-脱氮基-2'-脱氧腺苷（12b）的合成。还报道了提供吡咯并-C核苷7a的氮-1处的7-脱氮嘌呤-2-酮的区域选择性糖基化（19），并制备了具有末端三键的侧链衍生物（7d）。测定了这些核苷和相关化合物的荧光性质。乙炔核苷12b具有强荧光，显示134 nm的斯托克斯位移和Φ的量子产率= 0.53。它被证明在酸性和碱性介质中均稳定，而母体嘌呤化合物10b在两种条件下均不稳定。化合物12b被转化为其亚磷酰胺14，并被掺入寡核苷酸中。当化合物12b位于分子中心时，它会使寡核苷酸双链体失去稳定性；当掺入末端碱基对或充当突出的核苷时，它稳定。当化合物12b出现时，与温度相关的荧光测量可产生S型熔融曲线 当分子位于双链体中心的四个典型核苷的对面时，将其堆叠到末端碱基对上，同时观察到荧光的线性下降。

  DOI：

  10.1016/j.tet.2006.09.114
• 作为产物：
  描述：

  碘苷 在 四(三苯基膦)钯 copper(l) iodide 、 三乙胺 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 22.0h， 生成 3-(2-deoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)-6-pentyn-1-yl-furo[2,3-d]pyrimidin-3H-2-one
  参考文献：
  名称：

  1，N 6 -Etheno-2'-deoxytubercidin和pyrrolo-C：7-脱氮嘌呤核苷和寡核苷酸的合成，碱基配对和荧光性质

  摘要：

  描述了由7-脱氮基2'-脱氧腺苷（5a）与氯乙醛合成的1，N 6-乙炔基-7-脱氮基-2'-脱氧腺苷（12b）的合成。还报道了提供吡咯并-C核苷7a的氮-1处的7-脱氮嘌呤-2-酮的区域选择性糖基化（19），并制备了具有末端三键的侧链衍生物（7d）。测定了这些核苷和相关化合物的荧光性质。乙炔核苷12b具有强荧光，显示134 nm的斯托克斯位移和Φ的量子产率= 0.53。它被证明在酸性和碱性介质中均稳定，而母体嘌呤化合物10b在两种条件下均不稳定。化合物12b被转化为其亚磷酰胺14，并被掺入寡核苷酸中。当化合物12b位于分子中心时，它会使寡核苷酸双链体失去稳定性；当掺入末端碱基对或充当突出的核苷时，它稳定。当化合物12b出现时，与温度相关的荧光测量可产生S型熔融曲线 当分子位于双链体中心的四个典型核苷的对面时，将其堆叠到末端碱基对上，同时观察到荧光的线性下降。

  DOI：

  10.1016/j.tet.2006.09.114

文献信息

• BICYCLIC NUCLEOSIDE INHIBITORS OF VARICELLA-ZOSTER VIRUS (VZV): EFFECT OF TERMINAL UNSATURATION IN THE SIDE-CHAIN
  作者：Sheila Srinivasan、Christopher McGuigan、Graciela Andrei、Robert Snoeck、Erik De Clercq、Jan Balzarini

  DOI：10.1081/ncn-100002425

  日期：2001.3.31

  As part of an ongoing research program, we have prepared novel bicyclic nucleoside inhibitors bearing long alkyl side-chains for evaluation against VZV. In particular, we report the synthesis of analogues with terminal unsaturation in the side-chain. Terminal alkenyl derivatives were found to be potent antivirals whereas the terminal alkynyls displayed poor activity.
• Bicyclic nucleoside inhibitors of Varicella-Zoster virus (VZV)
  作者：Sheila Srinivasan、Christopher McGuigan、Graciela Andrei、Robert Snoeck、Erik De Clercq、Jan Balzarini

  DOI：10.1016/s0960-894x(00)00672-7

  日期：2001.2

  Novel bicyclic nucleoside analogues bearing long alkyl side chains are prepared and tested as inhibitors of VZV. In particular, analogues with terminal unsaturation in the side chain are reported. Whilst terminal alkenyl derivatives are potent antivirals, the corresponding terminal alkynyls are poorly active. (C) 2001 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.
• 1,N6-Etheno-2′-deoxytubercidin and pyrrolo-C: synthesis, base pairing, and fluorescence properties of 7-deazapurine nucleosides and oligonucleotides
  作者：Frank Seela、Enno Schweinberger、Kuiying Xu、Venkata Ramana Sirivolu、Helmut Rosemeyer、Eva-Maria Becker

  DOI：10.1016/j.tet.2006.09.114

  日期：2007.4

  The synthesis of 1,N6-etheno-7-deaza-2′-deoxyadenosine (12b) which was prepared from 7-deaza-2′-deoxyadenosine (5a) with chloroacetaldehyde is described. Also the regioselective glycosylation of the 7-deazapurine-2-one at nitrogen-1 (19) furnishing the pyrrolo-C nucleoside 7a is reported and a side chain derivative with a terminal triple bond (7d) is prepared. The fluorescence properties of these nucleosides

  描述了由7-脱氮基2'-脱氧腺苷（5a）与氯乙醛合成的1，N 6-乙炔基-7-脱氮基-2'-脱氧腺苷（12b）的合成。还报道了提供吡咯并-C核苷7a的氮-1处的7-脱氮嘌呤-2-酮的区域选择性糖基化（19），并制备了具有末端三键的侧链衍生物（7d）。测定了这些核苷和相关化合物的荧光性质。乙炔核苷12b具有强荧光，显示134 nm的斯托克斯位移和Φ的量子产率= 0.53。它被证明在酸性和碱性介质中均稳定，而母体嘌呤化合物10b在两种条件下均不稳定。化合物12b被转化为其亚磷酰胺14，并被掺入寡核苷酸中。当化合物12b位于分子中心时，它会使寡核苷酸双链体失去稳定性；当掺入末端碱基对或充当突出的核苷时，它稳定。当化合物12b出现时，与温度相关的荧光测量可产生S型熔融曲线 当分子位于双链体中心的四个典型核苷的对面时，将其堆叠到末端碱基对上，同时观察到荧光的线性下降。