Discovery of allosteric SHP2 inhibitors through ensemble-based consensus molecular docking, endpoint and absolute binding free energy calculations
作者:Maryam Jama、Marawan Ahmed、Anna Jutla、Carson Wiethan、Jitendra Kumar、Tae Chul Moon、Frederick West、Michael Overduin、Khaled H. Barakat
DOI:10.1016/j.compbiomed.2022.106442
日期:2023.1
interest. Given these roles, current research efforts have focused on developing SHP2 inhibitors. Allosteric SHP2 inhibitors have been shown to be more selective and pharmacologically appealing compared to competitive catalytic inhibitors targeting SHP2. Nevertheless, there remains a need for novel allosteric inhibitor scaffolds targeting SHP2 to develop compounds with improved selectivity, cell permeability
SHP2 (Src homology-2 domain-containing protein tyrosine phosphatase-2) 是由基因 PTPN11 编码的细胞质蛋白-酪氨酸磷酸酶。它在调节细胞生长和分化中起着至关重要的作用。具体而言,SHP2 是一种与发育病理学和几种不同癌症类型(包括胃癌、白血病和乳腺癌)相关的癌蛋白,具有很大的治疗意义。鉴于这些作用,当前的研究工作集中在开发 SHP2 抑制剂上。与针对 SHP2 的竞争性催化抑制剂相比,变构 SHP2 抑制剂已被证明更具选择性和药理学吸引力。尽管如此,仍然需要针对 SHP2 的新型变构抑制剂支架来开发具有更高选择性、细胞渗透性和生物利用度的化合物。为了这个目标,这项研究应用各种计算工具针对 SHP2 中的变构位点筛选了超过 600 万种化合物。我们排名靠前的热门歌曲使用蛋白质热位移和生物层干涉测量法验证了计算机内筛选,