5-(2-cyclohexylvinyl)-2'-deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)uridine | 1186011-98-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5-(2-cyclohexylvinyl)-2'-deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)uridine
• 英文别名: 5-cyclohexylvinyl-2'-deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)uridine；1-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]-5-(2-cyclohexylethenyl)pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 1186011-98-2
• 化学式: C₃₈H₄₂N₂O₇
• 分子量: 638.761
• InChiKey: FALQVYOJAFIESR-BMPTZRATSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.2
• 重原子数：
  47
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.37
• 拓扑面积：
  107
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-(2-cyclohexylvinyl)-2'-deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)uridine 、 双(二异丙基氨基)(2-氰基乙氧基)膦 在 四氮唑 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 5-cyclohexylvinyl-2'-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)uridine phosphoamidite
  参考文献：
  名称：

  Detection of methylcytosine by DNA photoligation via hydrophobic interaction of the alkyl group

  摘要：

  我们报告了通过使用模板引导的光连接通过 5-乙烯基-2'-脱氧尿苷衍生物进行高选择性的 5-甲基胞嘧啶非酶检测。在本文中，我们提出了一种利用疏水相互作用的新检测方法。 5-甲基胞嘧啶情况的光连接产率比胞嘧啶情况高约5.6倍。

  DOI：

  10.1039/b904941j
• 作为产物：
  描述：

  5-(2-cyclohexylvinyl)-2'-deoxyuridine 、 4,4'-双甲氧基三苯甲基氯 在 4-二甲氨基吡啶 、 三乙胺 作用下， 以 吡啶 为溶剂， 反应 16.0h， 以60%的产率得到5-(2-cyclohexylvinyl)-2'-deoxy-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)uridine
  参考文献：
  名称：

  Detection of methylcytosine by DNA photoligation via hydrophobic interaction of the alkyl group

  摘要：

  我们报告了通过使用模板引导的光连接通过 5-乙烯基-2'-脱氧尿苷衍生物进行高选择性的 5-甲基胞嘧啶非酶检测。在本文中，我们提出了一种利用疏水相互作用的新检测方法。 5-甲基胞嘧啶情况的光连接产率比胞嘧啶情况高约5.6倍。

  DOI：

  10.1039/b904941j

文献信息

• Method for detection of methylcytosine using photoresponsive probe
  申请人：Fujimoto Kenzo

  公开号：US08697357B2

  公开（公告）日：2014-04-15

  The present invention provides a method for detecting methylcytosine in DNA rapidly, conveniently, and with high sensitivity. The present invention relates to a method for detecting methylcytosine by using a methylcytosine photocoupling agent (a photoresponsive probe) consisting of nucleic acids having a group represented by the Formula (I), (II), (III) or (IV) as a base moiety.

  本发明提供了一种快速、方便和高灵敏度地检测DNA中甲基胞嘧啶的方法。本发明涉及一种使用甲基胞嘧啶光偶联剂（一种光响应探针），该光响应探针由具有代表公式（I）、（II）、（III）或（IV）的基团的核酸组成，用于检测甲基胞嘧啶的方法。
• METHOD FOR DETECTION OF METHYLCYTOSINE USING PHOTORESPONSIVE PROBE
  申请人：Japan Advanced Institute of Science and Technology

  公开号：EP2264044B1

  公开（公告）日：2014-08-20
• US8697357B2
  申请人：——

  公开号：US8697357B2

  公开（公告）日：2014-04-15
• Detection of methylcytosine by DNA photoligation via hydrophobic interaction of the alkyl group
  作者：Masayuki Ogino、Yuuta Taya、Kenzo Fujimoto

  DOI：10.1039/b904941j

  日期：——

  We report the nonenzymatic detection of 5-methylcytosine by using template-directed photoligation through 5-vinyl-2′-deoxyuridine derivatives with high selectivity. In this paper, we propose a new detection method by using hydrophobic interaction. The photoligation yield of the 5-methylcytosine case was approximately 5.6-fold higher than that in the case of cytosine.

  我们报告了通过使用模板引导的光连接通过 5-乙烯基-2'-脱氧尿苷衍生物进行高选择性的 5-甲基胞嘧啶非酶检测。在本文中，我们提出了一种利用疏水相互作用的新检测方法。 5-甲基胞嘧啶情况的光连接产率比胞嘧啶情况高约5.6倍。