5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl-1'-(6-aminohexyl))-2'-deoxy-β-D-ribofuranose | 637330-13-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl-1'-(6-aminohexyl))-2'-deoxy-β-D-ribofuranose
• 英文别名: (2R,3S,5R)-5-(6-aminohexoxy)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]oxolan-3-ol
• CAS: 637330-13-3
• 化学式: C₃₂H₄₁NO₆
• 分子量: 535.681
• InChiKey: DEFHSBFLOMAKQJ-OJDZSJEKSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.6
• 重原子数：
  39
• 可旋转键数：
  15
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.44
• 拓扑面积：
  92.4
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl-1'-(6-aminohexyl))-2'-deoxy-β-D-ribofuranose 在 1-羟基苯并三唑 、 三乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 19.0h， 生成 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-1'-β-(6-amido(2-(4-N,N'-dimethylaminophenylazo)phenyl)hexyl)-2'-deoxy-D-ribofuranose-3'-(2-cyanoethyl)-N,N-(diisopropyl)phosphoramidite
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of fluorophore and quencher monomers for use in Scorpion primers and nucleic acid structural probes

  摘要：

  我们报告了合成单体的方法，以将荧光素和美克红融入修饰的寡核苷酸的序列和末端。这些单体已应用于固相合成荧光基寡核苷酸，用于基因分析和多链核酸结构的研究。

  DOI：

  10.1039/b301859h
• 作为产物：
  描述：

  1'-(6-trifluoroacetamidohexyl)-2'-deoxy-α,β-D-ribofuranose 在 吡啶 、 sodium hydroxide 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 16.0h， 生成 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl-1'-(6-aminohexyl))-2'-deoxy-β-D-ribofuranose
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of fluorophore and quencher monomers for use in Scorpion primers and nucleic acid structural probes

  摘要：

  我们报告了合成单体的方法，以将荧光素和美克红融入修饰的寡核苷酸的序列和末端。这些单体已应用于固相合成荧光基寡核苷酸，用于基因分析和多链核酸结构的研究。

  DOI：

  10.1039/b301859h