mutant USP16CDC205A. Bottom-up mass spectrometric analysis of the covalent adduct with a deuterated propargyl ABP provides mechanistic understanding of the in situ thiol–alkyne reaction, identifying the alkyne rather than an allenic intermediate as the reactive species. Furthermore, kinetic analysis revealed that introduction of (bulky/electron-donating) methyl substituents on the propargyl moiety decreases
如今,末端未活化的
炔烃被认为是针对半胱
氨酸去泛素化酶 (DUB) 的活性探针 (ABP) 中半胱
氨酸反应弹头的黄
金标准。在这项工作中,我们更深入地研究了
硫醇-炔加成反应的多功能性。与之前 UCHL3 的研究结果相反,我们现在表明共价加合物的形成可以通过末端或内部
炔烃位置上的取代基进行。引人注目的是,对炔取代基的接受是严格针对 DUB 的,因为这在同一亚家族的成员中并不保守。通过对完整 ABP 处理的 U
SP16CD WT和催化失活突变体 U
SP16CD C205A进行凝胶分析和质谱分析,验证了与催化半胱
氨酸残基的共价加合物形成。对带有
氘代炔丙基 ABP 的共价加合物进行自下而上的质谱分析,提供了对原位
硫醇-炔反应的机理理解,识别出
炔烃而不是
丙二烯中间体作为反应物种。此外,动力学分析表明,在炔丙基部分引入(大体积/给电子)甲基取代基会降低共价加合物的形成速率,从而为观察到的共价加合物与未修饰