p-nitrophenyl 3<6-(4,4'-dimethoxytrityloxy)hexylcarbamoyl> propionate | 125674-95-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: p-nitrophenyl 3<6-(4,4'-dimethoxytrityloxy)hexylcarbamoyl> propionate
• 英文别名: 4-Nitrophenyl 3-[6-(4,4'-dimethoxytrityloxy)-hexylcarbamoyl]propanoate；p-nitrophenyl 3-[6-(4,4'-dimethoxytrityloxy)hexylcarbamoyl]propanoate；(4-Nitrophenyl) 4-[6-[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]hexylamino]-4-oxobutanoate
• CAS: 125674-95-5
• 化学式: C₃₇H₄₀N₂O₈
• 分子量: 640.733
• InChiKey: NOOVSVPSMUQPJD-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.6
• 重原子数：
  47
• 可旋转键数：
  18
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.3
• 拓扑面积：
  129
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  p-nitrophenyl 3<6-(4,4'-dimethoxytrityloxy)hexylcarbamoyl> propionate 、 L-leucyl-glycil-glycine methyl ester 在 4-二甲氨基吡啶 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以39%的产率得到methyl (4-((6-(bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)hexyl)amino)-4-oxobutanoyl)-L-leucylglycylglycinate
  参考文献：
  名称：

  一种制备肽-寡核苷酸偶联物的新方法

  摘要：

  已经开发了一种基于氧硫杂磷烷化学合成肽-寡核苷酸偶联物 (POC) 的新方法。分别制备的肽和寡核苷酸片段通过肽的官能化在合成后连接，通过将氧硫杂磷杂环戊烷残基直接连接在 N 末端或连接到 N 末端的接头的羟基进行连接。基于 DBU 辅助的寡核苷酸羟基对肽氧硫杂磷烷衍生物中磷原子的亲核攻击，共轭反应提供了所需的 POC。

  DOI：

  10.1055/s-0029-1217812
• 作为产物：
  描述：

  丁二酸酐 、 对硝基苯酚 、 6-氨基-1-己醇 、 4,4'-双甲氧基三苯甲基氯 生成 p-nitrophenyl 3<6-(4,4'-dimethoxytrityloxy)hexylcarbamoyl> propionate
  参考文献：
  名称：

  The solid phase synthesis of oligonucleotides containing a 3′-peptide moiety

  摘要：

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(00)95628-4

文献信息

• Oligonucleotide-polyamide conjugates
  申请人：HOWARD FLOREY INSTITUTE OF EXPERIMENTAL PHYSIOLOGY AND MEDICINE

  公开号：EP0972779A2

  公开（公告）日：2000-01-19

  Oligonucleotide-polyamide conjugates of the formula X-L-Y, where X is a polyamide, Y is an oligonucleotide, and L is a linker which forms a covalent bond with the amino-terminus of the polyamide X and the 3' phosphate group of the oligonucleotide Y. Conjugates may be synthesized by assembling a polyamide on a solid support matrix, adding a suitable linker molecule, followed by synthesis of the oligonucleotide. Methods for detecting specific polynucleotides with oligonucleotide-polyamide conjugates are also described.

  式 X-L-Y 的寡核苷酸-聚酰胺共轭物，其中 X 是聚酰胺，Y 是寡核苷酸，L 是连接体，它与聚酰胺 X 的氨基末端和寡核苷酸 Y 的 3'磷酸基团形成共价键。可通过在固体支持基质上组装聚酰胺，加入合适的连接分子，然后合成寡核苷酸来合成共轭物。还介绍了用寡核苷酸-聚酰胺共轭物检测特定多核苷酸的方法。
• OLIGONUCLEOTIDE-POLYAMIDE CONJUGATES
  申请人：HOWARD FLOREY INSTITUTE OF EXPERIMENTAL PHYSIOLOGY AND MEDICINE

  公开号：EP0383803B1

  公开（公告）日：2000-05-03
• US5525465A
  申请人：——

  公开号：US5525465A

  公开（公告）日：1996-06-11
• A Novel Approach to the Preparation of Peptide-Oligonucleotide Conjugates
  作者：Janina Baraniak、Renata Kaczmarek、Wojciech Stec

  DOI：10.1055/s-0029-1217812

  日期：2009.9

  A novel approach to the synthesis of peptide-oligonucleotide conjugates (POC) based on the oxathiaphospholane chemistry has been developed. Peptide and oligonucleotide fragments, which were separately prepared, were linked postsynthetically by the functionalization of the peptide either by attachment of the oxathiaphospholane residue directly at the N-terminus or at the hydroxy group of the linker

  已经开发了一种基于氧硫杂磷烷化学合成肽-寡核苷酸偶联物 (POC) 的新方法。分别制备的肽和寡核苷酸片段通过肽的官能化在合成后连接，通过将氧硫杂磷杂环戊烷残基直接连接在 N 末端或连接到 N 末端的接头的羟基进行连接。基于 DBU 辅助的寡核苷酸羟基对肽氧硫杂磷烷衍生物中磷原子的亲核攻击，共轭反应提供了所需的 POC。
• The solid phase synthesis of oligonucleotides containing a 3′-peptide moiety
  作者：Jim Haralambidis、Lucy Duncan、Geoffrey W. Tregear

  DOI：10.1016/s0040-4039(00)95628-4

  日期：——