N-(benzyl)-benzyloxycarbonyl-5-aminopentyl-O-(methyl-2-O-levulinoyl-3-O-benzyl-α-lidopyranosyluronate)-(1→4)-O-2-azido-3-O-benzyl-6-O-levulinoyl-α-D-glycopyranoside | 1198156-10-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 糖脂
• 英文名称: N-(benzyl)-benzyloxycarbonyl-5-aminopentyl-O-(methyl-2-O-levulinoyl-3-O-benzyl-α-lidopyranosyluronate)-(1→4)-O-2-azido-3-O-benzyl-6-O-levulinoyl-α-D-glycopyranoside
• 英文别名: N-(benzyl)-benzyloxycarbonyl-5-aminopentyl O-(methyl 2-O-levulinoyl-3-O-benzyl-α-L-idopyranosyluronate)-(1->4)-O-2-azido-3-O-benzyl-6-O-levulinoyl-2-deoxy-α-D-glucopyranoside；N-(benzyI)-benzyloxycarbonyl-5-aminopentyl O-(methyl-2-O-levulinoyl-3-O-benzyI-α-L-idopyranosyluronate)-(1→4)-O-2-azido-3-O-benzyI-2-deoxy-6-O-levulinoyl-α-D-glucopyranoside
• CAS: 1198156-10-3
• 化学式: C₅₇H₆₈N₄O₁₇
• 分子量: 1081.18
• InChiKey: PBANSVJYIUYCBX-RDZCRTTPSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.42
• 重原子数：
  78.0
• 可旋转键数：
  30.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.47
• 拓扑面积：
  266.95
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  18.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-(benzyl)-benzyloxycarbonyl-5-aminopentyl-O-(methyl-2-O-levulinoyl-3-O-benzyl-α-lidopyranosyluronate)-(1→4)-O-2-azido-3-O-benzyl-6-O-levulinoyl-α-D-glycopyranoside 在 双氧水 、 乙酸肼 、 lithium hydroxide 作用下， 以 乙醇 、 水 、 甲苯 为溶剂， 反应 26.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  完全基于硫酸乙酰肝素的神经组织构建体，可维持神经干细胞的未分化状态。

  摘要：

  肝素和硫酸乙酰肝素（HS）由于其募集和调节生长因子活性的能力而成为构建生物材料的诱人成分。然而，天然来源的肝素和HS的结构和功能异质性是制备再生医学生物材料的障碍。为了解决这个问题，我们准备了由明确定义的合成HS衍生的二糖修饰的水凝胶。人类诱导的多潜能细胞源性神经干细胞（HIP-NSC）封装在由悬垂的HS二糖修饰的聚乙二醇基水凝胶中，HS二糖是成纤维细胞生长因子2（FGF-2）的已知配体，表现出增殖的显着增加和自我更新。该观察很重要，因为越来越多的证据表明未分化的干细胞可通过其旁分泌信号传导机制产生重大的治疗益处。我们的数据表明，HS二糖可保护FGF-2（具有非常短的生物学半衰期）免受降解。可以预料的是，通过仔细选择合成的HS寡糖，可以控制特定生长因子的保留和释放，进而可以控制细胞命运。

  DOI：

  10.1021/acschembio.9b00401
• 作为产物：
  描述：

  N-(benzyl)-benzyloxycarbonyl-5-aminopentyl O-2-azido-6-O-levulinoyl-3-O-benzyl-2-deoxy-α-D-glycopyranoside 在 2,2,6,6-四甲基哌啶氧化物 、 碘苯二乙酸 、 对甲苯磺酸 、 乙硫醇 作用下， 以 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 N-(benzyl)-benzyloxycarbonyl-5-aminopentyl-O-(methyl-2-O-levulinoyl-3-O-benzyl-α-lidopyranosyluronate)-(1→4)-O-2-azido-3-O-benzyl-6-O-levulinoyl-α-D-glycopyranoside
  参考文献：
  名称：

  New glucuronic acid donors for the modular synthesis of heparan sulfate oligosaccharides

  摘要：

  已开发出一种简化的方法，用于制备模块化二糖建筑块，用于组装避免后糖基化氧化的HS寡糖库。

  DOI：

  10.1039/c3ob42312c

文献信息

• Modular Synthesis of Heparan Sulfate Oligosaccharides for Structure−Activity Relationship Studies
  作者：Sailaja Arungundram、Kanar Al-Mafraji、Jinkeng Asong、Franklin E. Leach、I. Jonathan Amster、Andre Venot、Jeremy E. Turnbull、Geert-Jan Boons

  DOI：10.1021/ja907358k

  日期：2009.12.2

  to the structural complexity of natural heparan sulfate (HS) and difficulties of preparing well-defined HS oligosaccharides. To address this deficiency, we developed a modular approach for the parallel combinatorial synthesis of HS oligosaccharides that utilizes a relatively small number of selectively protected disaccharide building blocks, which can easily be converted into glycosyl donors and acceptors

  尽管已经鉴定了数百种硫酸乙酰肝素结合蛋白并与无数生理和病理过程有关，但关于这些蛋白结合和介导生物活性的配体要求的信息知之甚少。这种困难是由于缺乏建立构效关系的技术，而这又是由于天然硫酸乙酰肝素 (HS) 的结构复杂性和制备明确定义的 HS 寡糖的困难。为了解决这一缺陷，我们开发了一种模块化方法，用于 HS 寡糖的平行组合合成，该方法利用相对少量的选择性保护的二糖结构单元，这些结构单元可以很容易地转化为糖基供体和受体。模块化构建块的实用性已通过 12 种寡糖文库的制备得到证明，该文库已被用于探测 HS 抑制蛋白酶 BACE-1 的结构特征。具有结构变化的活动的复杂变化支持重要功能信息嵌入在 HS 序列中的观点。此外，最活跃的衍生物为制备更有效的化合物提供了一种有吸引力的先导化合物，这些化合物可用作阿尔茨海默病的治疗剂。具有结构变化的活动的复杂变化支持重要功能信息嵌入在 HS 序列中的观点。此
• Heparan Sulfate Microarray Reveals That Heparan Sulfate–Protein Binding Exhibits Different Ligand Requirements
  作者：Chengli Zong、Andre Venot、Xiuru Li、Weigang Lu、Wenyuan Xiao、Jo-Setti L. Wilkes、Catherina L. Salanga、Tracy M. Handel、Lianchun Wang、Margreet A. Wolfert、Geert-Jan Boons

  DOI：10.1021/jacs.7b01399

  日期：2017.7.19

  into 12 differently sulfated derivatives. By employing tetrasaccharides with different backbone compositions, a library of 47 HS-oligosaccharides was prepared and the resulting compounds were used to construct a HS microarray. The ligand requirements of a number of HS-binding proteins including fibroblast growth factor 2 (FGF-2), and the chemokines CCL2, CCL5, CCL7, CCL13, CXCL8, and CXCL10 were examined

  硫酸乙酰肝素 (HS) 是线性硫酸化多糖，可调节多种生理和疾病过程。HS 差向异构化和硫酸化的变化提供了巨大的结构多样性，这被认为是蛋白质结合和调节特性的基础。然而，HS 结合蛋白的配体要求仅在少数情况下得到定义。我们在这里描述了一种合成方法，可以快速提供明确的 HS 寡糖库。它基于使用模块化二糖来组装几种选择性保护的四糖，这些四糖经过选择性化学修饰，例如区域选择性 O- 和 N-硫酸化以及选择性脱硫酸化。许多所得化合物通过 3-O-磺基转移酶-1 (3-OST1) 进行酶促修饰，得到 3-O-硫酸化衍生物。各种多样化方法允许将一种四糖转化为 12 种不同的硫酸化衍生物。通过使用具有不同主链组成的四糖，制备了 47 种 HS-寡糖的文库，并将所得化合物用于构建 HS 微阵列。使用该阵列检查了许多 HS 结合蛋白的配体需求，包括成纤维细胞生长因子 2 (FGF-2) 和趋化因子 CCL2、C
• Synthetic Heparanase Inhibitors Can Prevent Herpes Simplex Viral Spread
  作者：Pradeep Chopra、Tejabhiram Yadavalli、Francesco Palmieri、Seino A. K. Jongkees、Luca Unione、Deepak Shukla、Geert‐Jan Boons

  DOI：10.1002/anie.202309838

  日期：2023.10.9

  Herpes simplex virus (HSV‐1) employs heparan sulfate (HS) as receptor for cell attachment and entry. During late‐stage infection, the virus induces the upregulation of human heparanase (Hpse) to remove cell surface HS allowing viral spread. We hypothesized that inhibition of Hpse will prevent viral release thereby representing a new therapeutic strategy for HSV‐1. A range of HS‐oligosaccharides was prepared to examine the importance of chain length and 2‐O‐sulfation of iduronic moieties for Hpse inhibition. It was found that hexa‐ and octasaccharides potently inhibited the enzyme and that 2‐O‐sulfation of iduronic acid is tolerated. Computational studies provided a rationale for the observed structure–activity relationship. Treatment of human corneal epithelial cells (HCEs) infected with HSV‐1 with the hexa‐ and octasaccharide blocked viral induced shedding of HS which significantly reduced spread of virions. The compounds also inhibited migration and proliferation of immortalized HCEs thereby providing additional therapeutic properties.

  摘要 单纯疱疹病毒（HSV-1）利用硫酸肝素（HS）作为细胞附着和进入细胞的受体。在感染后期，病毒会诱导人肝素酶（Hpse）上调，以清除细胞表面的硫酸肝素，从而使病毒扩散。我们假设抑制 Hpse 将阻止病毒释放，从而成为治疗 HSV-1 的新策略。我们制备了一系列 HS 寡糖，以研究链长和偶聚糖分子的 2-O 磺化对 Hpse 抑制作用的重要性。研究发现，六糖和八糖对该酶有强效抑制作用，而iduronic酸的2-O-硫酸化是可以容忍的。计算研究为观察到的结构-活性关系提供了理论依据。用六糖和八糖处理感染了 HSV-1 的人类角膜上皮细胞（HCEs），可阻止病毒引起的 HS 脱落，从而显著减少病毒的传播。这些化合物还能抑制永生化 HCE 的迁移和增殖，从而提供额外的治疗特性。