酪蛋白水解
蛋白酶 P (ClpP) 是一种参与细胞稳态和致病性的中心细菌降解机制。ClpP 的功能作用已经通过
基因敲除和β-内酯的使用进行了研究,β-内酯仍然是迄今为止发现的唯一的 ClpP 特异性
抑制剂。β-内酯已作为
化学工具在多种
生物体中操纵 ClpP;然而,它们的效力、选择性和稳定性是有限的。尽管对 ClpP 活性位点的组成和构象灵活性有详细的结构见解,但迄今为止还没有报道设计特定的非 β-内酯
抑制剂的合理努力。在这项工作中,对超过 137 000 种化合物的无偏见筛选用于鉴定五种苯酯化合物作为高效的 ClpP
抑制剂,这些
抑制剂对细菌、但不是人类 ClpP。在 ClpP 肽酶和
蛋白酶抑制试验中,苯基酯的效力大大超过了 β-内酯,并在活的
金黄色葡萄球菌细胞中显示出独特的靶标选择性。分析研究表明,虽然苯基酯像天然肽底物一样被裂解,但它们仍然作为酰基酶中间体共价捕获在活性位点中。36 种衍
生物的合成和随后的构效关系