2,3,4,5,6-pentafluorophenyl 3-{[3-({3-[4-({3-[bis(4-methoxyphenyl)phenylmethoxy]propyl{}4-[(2-chloro-4-nitrophenyl)diazenyl]phenyl}amino)butanoyl]pyrrolo[4,5-e]indolin-7-yl}carbonyl)pyrrolo[4,5-e]indolin-7-yl]carbonyl}pyrrolo[4,5-e]indoline-7-carboxylate | 344436-43-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 2,3,4,5,6-pentafluorophenyl 3-{[3-({3-[4-({3-[bis(4-methoxyphenyl)phenylmethoxy]propyl{}4-[(2-chloro-4-nitrophenyl)diazenyl]phenyl}amino)butanoyl]pyrrolo[4,5-e]indolin-7-yl}carbonyl)pyrrolo[4,5-e]indolin-7-yl]carbonyl}pyrrolo[4,5-e]indoline-7-carboxylate
• 英文别名: (2,3,4,5,6-pentafluorophenyl) 6-[6-[6-[4-[N-[3-[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]propyl]-4-[(2-chloro-4-nitrophenyl)diazenyl]anilino]butanoyl]-7,8-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-e]indole-2-carbonyl]-7,8-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-e]indole-2-carbonyl]-7,8-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-e]indole-2-carboxylate
• CAS: 344436-43-7
• 化学式: C₇₉H₆₂ClF₅N₁₀O₁₀
• 分子量: 1441.87
• InChiKey: FIZQWIIYHPFLBB-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  15.9
• 重原子数：
  105
• 可旋转键数：
  22
• 环数：
  15.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.19
• 拓扑面积：
  236
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  18

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  、 三氟乙酸五氟苯酯 在 三乙胺 作用下， 以 DMF (N,N-dimethyl-formamide) 为溶剂， 以85%的产率得到2,3,4,5,6-pentafluorophenyl 3-{[3-({3-[4-({3-[bis(4-methoxyphenyl)phenylmethoxy]propyl{}4-[(2-chloro-4-nitrophenyl)diazenyl]phenyl}amino)butanoyl]pyrrolo[4,5-e]indolin-7-yl}carbonyl)pyrrolo[4,5-e]indolin-7-yl]carbonyl}pyrrolo[4,5-e]indoline-7-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  Fluorescent quenching detection reagents and methods

  摘要：

  寡核苷酸-荧光素-猝灭剂共轭物，其中荧光素部分的发射波长在大约300到800纳米范围内，或者猝灭剂包括取代的4-(苯基重氮基)苯胺结构，在杂交和相关测定中提供了改善的信噪比和其他有利特性。这些寡核苷酸-荧光素-猝灭剂共轭物可以通过利用基于取代的4-(苯基重氮基)苯胺结构的新型磷酸酰胺试剂合成，或者利用基于取代香豆素、取代7-羟基-3H-苯并噁唑-3-酮或取代5,10-二氢-10-[苯基]吡啶[2,3-d;6,5-d']二嘧啶-2,4,6,8-(1H,3H,7H,9H,10H)-四酮结构的新型磷酸酰胺试剂合成。包括吡咯并[4,5-e]吲哚-7-基)吡咯并[4,5-e]吲哚-7-基)吡咯并[4,5-e]吲哚-7-羧酸酯(DPI3)部分作为次生沟结合剂和取代的4-(苯基重氮基)苯胺部分作为猝灭剂的寡核苷酸-荧光素-猝灭剂-次生沟结合剂共轭物已经合成，并具有显着改善的杂交和信噪比特性。

  公开号：

  US06699975B2