Pyridomycin 是一种有效的抗分枝杆菌
天然产物,通过特异性抑制 InhA,InhA 是一种临床验证的抗结核药物发现靶标。
吡啶霉素的
吡啶基部分通过占据烟酰胺
腺嘌呤二核苷酸 (
NADH) 辅助因子结合位点的还原形式,在抑制 InhA 中发挥重要作用。在此,我们对 PyrZ 进行生化表征,它是一种多功能 NadC 同系物,可催化
烟酸单核苷酸 (N
AMN) 的连续形成、去
磷酸化和
核糖水解,生成
烟酸 (NA),
烟酸 (NA) 是
吡啶霉素
吡啶基部分的
生物合成前体。与底物
喹啉酸 (QA) 和最终产物 NA 复合的 PyrZ 的晶体结构揭示了在 K184 和 QA 的 C3-羧基之间形成的特定盐桥。这种相互作用将 QA 定位为接受
磷酸核糖基团以生成 N
AMN,将 N
AMN 保留在活性位点内,并介导其易位至亲核试剂 D296 以进行去
磷酸化。结合动力学和热力学分析与定点诱变,提出了 PyrZ 去
磷酸