5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-N⁶-isopent-2-enyl-2'-O-{[(triisopropylsilyl)oxy]methyl}adenosine 3'-(2-cyanoethyl diisopropylphosphoramidite)

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-N⁶-isopent-2-enyl-2'-O-{[(triisopropylsilyl)oxy]methyl}adenosine 3'-(2-cyanoethyl diisopropylphosphoramidite)
• 英文别名: 3-[[(2R,3R,4R,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-[6-(3-methylbut-2-enylamino)purin-9-yl]-4-[tri(propan-2-yl)silyloxymethoxy]oxolan-3-yl]oxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxypropanenitrile
• 化学式: C₅₅H₇₈N₇O₈PSi
• 分子量: 1024.33
• InChiKey: ZSUCZNPNKIEXOM-MDFPAVTBSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  12.32
• 重原子数：
  72
• 可旋转键数：
  27
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.53
• 拓扑面积：
  157
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  14

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  3-甲基-2-丁烯-1-胺盐酸盐(1:1) 在 吡啶 、 氨 、 三乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 吡啶 、 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 11.0h， 生成 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-N⁶-isopent-2-enyl-2'-O-{[(triisopropylsilyl)oxy]methyl}adenosine 3'-(2-cyanoethyl diisopropylphosphoramidite)
  参考文献：
  名称：

  包含各种核碱基类似物的2'- O -[（三异丙基甲硅烷基）氧基]甲基（= tom）保护的核糖核苷亚磷酰胺的合成

  摘要：

  报道了旨在有效制备多种2'- O -[（三异丙基甲硅烷基）氧基]甲基（＝ tom）保护的含有修饰的核碱基的核糖核苷亚磷酰胺结构单元的研究的第一结果。所有这里提出的核苷已经掺入到RNA序列通过其他几组，采用2'- ö -tbdms-或2'- ø -汤姆保护的亚磷酰胺结构单元（TBDMS =（叔丁基）二甲基甲硅烷）。现在，我们优化了现有反应，开发了一些新的和较短的合成策略，有时还引入了其他核碱基保护基团。2'- ø -汤姆，5'- ø - （二甲氧基三苯甲基）保护的核糖核苷Ñ2-乙酰基异胞苷5，O 2-（二苯基氨基甲酰基）-N 6-异丁酰基异鸟苷8，N 6-异丁酰基-N 2-（甲氧基乙酰基）嘌呤-2,6-二胺核糖核苷（=  N 8-异丁酰基-2-[（甲氧基乙酰基）氨基]腺苷）11，5-甲基尿苷13，和5,6-二氢尿苷15通过首先引入核碱基保护基团和二甲氧基三苯甲基，分别，接着2'-制备ø -汤姆基（方案1）。另一个呈现2'-

  DOI：

  10.1002/hlca.200590209