Diethyl 2-[(4,4',4"-trimethoxytrityl)oxymethyl]-2-hydroxymethylmalonate | 363625-51-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: Diethyl 2-[(4,4',4"-trimethoxytrityl)oxymethyl]-2-hydroxymethylmalonate
• 英文别名: diethyl 2-[(4,4',4''-trimethoxytrityl)oxymethyl]-2-hydroxymethylmalonate；diethyl 2-(hydroxymethyl)-2-[tris(4-methoxyphenyl)methoxymethyl]propanedioate
• CAS: 363625-51-8
• 化学式: C₃₁H₃₆O₉
• 分子量: 552.621
• InChiKey: DWDJFXKLTMBKCO-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.5
• 重原子数：
  40
• 可旋转键数：
  16
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.35
• 拓扑面积：
  110
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Diethyl 2-[(4,4',4"-trimethoxytrityl)oxymethyl]-2-hydroxymethylmalonate 在 四氮唑 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 Diethyl[[[tris(4-methoxyphenyl)methyl]oxy]methyl][[[[bis(1-methylethyl)amino][(9H-fluorene-9-yl)methoxy]phosphino]oxy]methyl]propanedioate
  参考文献：
  名称：

  Novel reagents for terminal phosphorylation and thiophosphorylation of synthetic oligonucleotides

  摘要：

  Two novel phosphoramidite building blocks and a solid support that allow an efficient solid-phase phosphorylation or thiophosphorylation of synthetic oligonucleotides were developed. The utility of these synthetic tools was demonstrated in the preparation of 5 '- or 3 ' -thiophosphorylated oligonucleotides, which were subsequently labeled at the termini with fluorescent reporters. (C) 2001 Elsevier Science Ltd. All lights reserved.

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(01)00834-6
• 作为产物：
  描述：

  双羟甲基丙二酸二乙酯 、 4,4’,4’-三甲氧基苯甲基氯 在 二氯甲烷 、 碳酸氢钠 、 Brine 、 Sodium sulfate-III 、 silica gel 作用下， 以 吡啶 、 1,4-二氧六环 为溶剂， 反应 16.0h， 以to give 1 (8.2 g, 67.5%) as an oil的产率得到Diethyl 2-[(4,4',4"-trimethoxytrityl)oxymethyl]-2-hydroxymethylmalonate
  参考文献：
  名称：

  Labeled oligonucleotides, methods for making same, and compounds useful therefor

  摘要：

  本发明涉及可选择性地功能化的寡核苷酸，以及制备方法和有用的化合物。该寡核苷酸可以在3'-端位置选择性地功能化第一共轭基团，并可以在5'-端位置和/或一个或多个核苷酸之间选择性地功能化第二共轭基团。或者，该寡核苷酸可以在5'-端位置选择性地功能化第一共轭基团，并可以在一个或多个核苷酸之间选择性地功能化第二共轭基团。在另一种实施方式中，该寡核苷酸可以在一个或多个核苷酸之间选择性地功能化第一共轭基团，并在一个或多个不同的核苷酸之间选择性地功能化第二共轭基团。

  公开号：

  US06825338B2

文献信息

• Labeled oligonucleotides, methods for making same, and compounds useful therefor
  申请人：——

  公开号：US20030208061A1

  公开（公告）日：2003-11-06

  Selectively functionalized oligonucleotides, methods for making same, and compounds useful therefor are disclosed. The oligonucleotides can be selectively functionalized with a first conjugate group at the 3′-terminial position and optionally functionalized with a second conjugate group at the 5′-terminal position and/or one or more internucleotides. Alternatively, the oligonucleotides can be selectively functionalized with a first conjugate group at the 5′-terminal position and optionally functionalized with a second conjugate group at one or more internucleotides. In yet another embodiment, the oligonucleotides can be functionalized with a first conjugate group at one or more internucleotides and with a second conjugate group at one or more different internucleotides.

  选择性功能化寡核苷酸，制备方法以及用于此目的的化合物已被披露。这些寡核苷酸可以在3'-末端位置选择性地与第一共轭基团功能化，并可选择性地在5'-末端位置和/或一个或多个核苷酸之间与第二共轭基团功能化。另外，这些寡核苷酸可以在5'-末端位置选择性地与第一共轭基团功能化，并可选择性地在一个或多个核苷酸之间与第二共轭基团功能化。在另一实施方式中，这些寡核苷酸可以在一个或多个核苷酸之间与第一共轭基团功能化，并在一个或多个不同的核苷酸之间与第二共轭基团功能化。
• US6825338B2
  申请人：——

  公开号：US6825338B2

  公开（公告）日：2004-11-30
• Novel reagents for terminal phosphorylation and thiophosphorylation of synthetic oligonucleotides
  作者：Andrei P Guzaev、Muthiah Manoharan

  DOI：10.1016/s0040-4039(01)00834-6

  日期：2001.7

  Two novel phosphoramidite building blocks and a solid support that allow an efficient solid-phase phosphorylation or thiophosphorylation of synthetic oligonucleotides were developed. The utility of these synthetic tools was demonstrated in the preparation of 5 '- or 3 ' -thiophosphorylated oligonucleotides, which were subsequently labeled at the termini with fluorescent reporters. (C) 2001 Elsevier Science Ltd. All lights reserved.