2-(trimethylsilyl)ethyl N,N,N',N'-tetraisopropylphosphorodiamidite | 149578-28-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机盐 - 有机金属盐
• 英文名称: 2-(trimethylsilyl)ethyl N,N,N',N'-tetraisopropylphosphorodiamidite
• 英文别名: N-[[di(propan-2-yl)amino]-(2-trimethylsilylethoxy)phosphanyl]-N-propan-2-ylpropan-2-amine
• CAS: 149578-28-9
• 化学式: C₁₇H₄₁N₂OPSi
• 分子量: 348.585
• InChiKey: SNDSMYHDVNWLRH-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  365.7±44.0 °C(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.81
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  1.0
• 拓扑面积：
  15.7
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-(trimethylsilyl)ethyl N,N,N',N'-tetraisopropylphosphorodiamidite 在 四氮唑 、 二异丙基铵盐四氮唑 作用下， 以 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 [(2R,3R,4R,5R)-3,4-dibenzoyloxy-5-[6-[[[(3R,4R,5R)-3,4-diacetyloxy-5-(acetyloxymethyl)oxolan-2-yl]oxy-(2-trimethylsilylethoxy)phosphanyl]amino]purin-9-yl]oxolan-2-yl]methyl benzoate
  参考文献：
  名称：

  New Nucleoside−Sugar Conjugates:  6-N-Glycosyloxyphosphorylated Adenosine Derivatives as Partial Structures of Agrocin 84

  摘要：

  We report the first successful synthesis of 6-N-[(glucofuranos-1-yloxy)phosphoryl]adenosine as a partial structure of Agrocin 84 via a two-step phosphorylation of 2',3',5'-tri-O-benzoyladenosine with a 2,3,5,6-tetra-O-acetylglucofuranoside 1-O-phosphoramidite derivative that has a 2-(trimethylsilyl)ethyl group as the phosphate protecting group. A similar nucleoside-sugar conjugate, 6-N-[(ribofuranos-1-yloxy)phosphoryl]ade was also synthesized. The stabilities of these 6-N-[(glycos-1-yloxy)phosphoryl] adeno sine derivatives under acidic, basic, and thermal conditions are described. In particular, we found that the P-O bond of these sugar-nucleoside conjugates was selectively cleaved by treatment with 0.1 M NaOH to give 6-N-phosphoryladenosine, while acidic treatment gave directly adenosine with cleavage of the P-N bond.

  DOI：

  10.1021/jo961489a
• 作为产物：
  描述：

  trimethyl(2-(trimethylsilyl)ethoxy)silane 在 三氯化磷 作用下， 以 乙醚 为溶剂， 反应 1.0h， 生成 2-(trimethylsilyl)ethyl N,N,N',N'-tetraisopropylphosphorodiamidite
  参考文献：
  名称：

  2-（三甲基甲硅烷基）乙基为寡核苷酸合成中的磷酸酯保护基

  摘要：

  发现2-（三甲基甲硅烷基）乙基（TSE）基团作为寡核苷酸合成中核苷酸间磷酸的保护基是有效的。具有良好产率的具有TSE基团的亚磷酰胺构件被制备。在脱氧鸟苷的情况下，合成了2- N-未保护的亚磷酰胺结构单元。这些化合物被用于寡脱氧核糖核苷酸的固相合成。通过31 P NMR阐明了与未保护的鸟嘌呤部分相关的副反应。

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(00)75810-2

文献信息

• Synthesis and Properties of Aminoacylamido-AMP:  Chemical Optimization for the Construction of an <i>N</i>-Acyl Phosphoramidate Linkage
  作者：Tomohisa Moriguchi、Terukazu Yanagi、Masao Kunimori、Takeshi Wada、Mitsuo Sekine

  DOI：10.1021/jo0008338

  日期：2000.12.1

  This paper describes the design and synthesis of a new type of aminoacyl-adenylate analogue (aa-AMPN) having an N-acyl phosphoramidate linkage where the oxygen atom of the mixed anhydride bond of aminoacyl-adenylate (aa-AMP) is replaced by an amino group. This new type of aa-AMP analogue is expected to be useful as material for studies on the recognition mechanism of the aminoacylation of tRNA and

  本文介绍了具有N-酰基氨基磷酸酯键的新型氨基酰基-腺苷酸类似物（aa-AMPN）的设计和合成，其中氨基酰基-腺苷酸（aa-AMP）的混合酸酐键的氧原子被氨基。这种新型的aa-AMP类似物有望用作研究tRNA氨基酰化和其他生化反应识别机制的材料。羧酰胺的亚磷酰胺衍生物与核苷衍生物的缩合失败，因为活化的亚磷酰胺衍生物不仅与羟基反应，而且与另一种反应性物质反应。通过5'-O-亚磷酰胺基腺苷衍生物与羧酰胺衍生物的反应研究了另一种方法。选择TBTr和TSE基团分别用于保护氨基酸酰胺的氨基和磷酸基。详细研究表明，使用5-（3,5-二硝基苯基）-1H-四唑作为亚磷酰胺的活化催化剂可在10分钟内迅速缩合，从而得到完全保护的aa-AMPN衍生物。没有发生副反应。通过两步程序对这些产物进行脱保护，得到高产率的aa-AMPN衍生物。还证明由此获得的aa-AMPN在酸性和碱性条件下均是稳定的，例如0.1M HCl（pH
• SILYL PROTECTING GROUPS FOR OLIGONUCLEOTIDE SYNTHESIS REMOVED BY A ZnBr₂TREATMENT
  作者：Fernando Ferreira、François Morvan

  DOI：10.1081/ncn-200060342

  日期：2005.4.1

  An oligonucleotide protected with N-(trimethylsilyloxycarbonyl) (Teoc) and P-(trimethylsilylethanol) (Tse) groups was synthesized and deprotected by a single ZnBr2 treatment. Finally it was released from the solid support by cleavage of a disulfide linkage with TCEP. The oligonucleotide was obtained without any basic treatment.

  合成了用 N-(三甲基甲硅烷氧基羰基) (Teoc) 和 P-(三甲基甲硅烷基乙醇) (Tse) 基团保护的寡核苷酸，并通过单一的 ZnBr2 处理脱保护。最后，它通过与 TCEP 的二硫键断裂而从固体支持物上释放出来。寡核苷酸是在没有任何碱性处理的情况下获得的。
• First Synthesis and Anticancer Activity of Phosmidosine and Its Related Compounds
  作者：Tomohisa Moriguchi、Norio Asai、Kazuhisa Okada、Kohji Seio、Takuma Sasaki、Mitsuo Sekine

  DOI：10.1021/jo016176g

  日期：2002.5.1

  the presence of 5-(3,5-dinitrophenyl)-1H-tetrazole. The successful synthesis of phosmidosine was achieved by use of a tert-butoxycarbonyl (Boc) group, which was found to be selectively introduced into the 7-NH function of 8-oxoadenosine and to serve as a pseudo-protecting group due to its steric effect in such manner that the unmasked 6-amino group was not phosphitylated. Final coupling reaction of the

  本文描述了膦酰胺和膦嘧啶B的首次合成，即由8-氧代腺苷和L-脯氨酸组成的核苷酸抗生素，它们通过独特的N-酰基氨基磷酸酯键连接。膦酰胺在N-酰基氨基磷酸酯键的磷原子上具有尚未确定的手性中心。磷肌苷B是一种脱磷的磷肌苷衍生物，在磷上没有手性。在5-（3,5-二硝基苯基）-1H-四唑存在下，N-乙酰基-8-氧代腺苷5'-O-亚磷酰胺衍生物与N-保护的脯氨酰胺反应成功地合成了肌苷B。通过使用叔丁氧羰基（Boc）基团可以成功合成膦嘧啶 发现它被选择性地引入到8-氧代腺苷的7-NH官能团中，并由于其空间效应而以未保护的6-氨基未被磷酸化的方式用作假保护基团。8-氧代腺苷5'-亚磷酰胺衍生物与N-三苯甲基脯氨酰胺的最终偶联反应，然后完全脱保护，得到膦酰胺及其非对映异构体的混合物。非对映异构体的（13）C NMR光谱表明，缓慢洗脱的非对映异构体1b是天然存在的膦酰胺。通过MTT分析评价了膦肌苷1b，其非对
• Synthesis and Properties of Oligodeoxynucleotides Incorporating a Conformationally Rigid Uridine Unit Having a Cyclic Structure at the 5‘-Terminal Site
  作者：Mitsuo Sekine、Osamu Kurasawa、Koh-ichiroh Shohda、Kohji Seio、Takeshi Wada

  DOI：10.1021/jo991374h

  日期：2000.6.1

  between the 5-position of the uracil residue and the 5'-phosphate group was synthesized. The NMR analysis suggests that this cyclouridylic acid derivative has exclusively the C3'-endo conformation that is in favor of duplex formation with RNA. Two oligonucleotides ¿pc3Um(pT)(9) and pc3Um(pU)(9) incorporating this cyclouridylic acid unit at the 5'-terminal site were synthesized by using the fully protected

  合成具有在尿嘧啶残基的5位和5'-磷酸基团之间连接的环状结构的2'-O-甲基尿苷酸衍生物3。NMR分析表明，该环尿苷酸衍生物仅具有C3'-endo构象，有利于与RNA形成双链体。通过在固相中使用完全保护的环尿苷酸3'-亚磷酰胺衍生物11，合成了两个在5'-末端位带有该环尿苷酸单元的寡核苷酸pc3Um（pT）（9）和pc3Um（pU）（9）。合成。为了检查这种环状结构对修饰寡核苷酸及其互补寡核苷酸之间双链体热稳定性的实际影响，还合成了具有无环结构的两个寡核苷酸——pUm（pT）（9）和pUm（pU）（9）。作为互补寡核苷酸，将dA（pdA）（9）和A（pA）（9）用于这些5'末端修饰寡核苷酸的T（m）实验。测量所有可能的双链体的T（m）值。这些结果清楚地表明，pc3Um（pT）（9）-A（pA）（9）的双链体比A（pA）（9）-T（pT）的T（m）值高5.5摄氏度。 （9）。与所有其他情况相
• Krotz, Achim H.; Wheeler, Patrick; Ravikumar, Vasulinga T., Angewandte Chemie, 1995, vol. 107, # 21, p. 2584 - 2587
  作者：Krotz, Achim H.、Wheeler, Patrick、Ravikumar, Vasulinga T.

  DOI：——

  日期：——