5'-Dimethoxytrityl-2'-deoxyuridine-5-<2-(N'-(trifluoroacetyl)amino)ethyl>propionamide | 121329-87-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-Dimethoxytrityl-2'-deoxyuridine-5-<2-(N'-(trifluoroacetyl)amino)ethyl>propionamide
• 英文别名: 5’-O-(4,4’-dimethoxytrityl)-5-[2-(trifluoroacetylamino)ethylaminocarbonylethyl]-2’-deoxyuridine；5'-(4,4'-dimethoxytriphenylmethyl)-5-[N-(2-trifluoroacetamidoethyl)aminocarbonylethyl]-2'-deoxyuridine；3-[1-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]-2,4-dioxopyrimidin-5-yl]-N-[2-[(2,2,2-trifluoroacetyl)amino]ethyl]propanamide
• CAS: 121329-87-1
• 化学式: C₃₇H₃₉F₃N₄O₉
• 分子量: 740.733
• InChiKey: WJDRESUQFVAXCH-XAGDYJCDSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.94
• 重原子数：
  53.0
• 可旋转键数：
  15.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.35
• 拓扑面积：
  170.21
• 氢给体数：
  4.0
• 氢受体数：
  10.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  氯(二异丙基氨基)甲氧基膦 、 5'-Dimethoxytrityl-2'-deoxyuridine-5-<2-(N'-(trifluoroacetyl)amino)ethyl>propionamide 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.0h， 以85%的产率得到5'-Dimethoxytrityl-2'-deoxyuridine-5-<2-(N'-(trifluoroacetyl)amino)ethyl>propionamide-3'-(O-methyl(diisopropylamino))phosphoramidate
  参考文献：
  名称：

  含有共价连接分子标记的 DNA 寡聚体和双链体的合成和表征：通过热力学和光学光谱测量比较生物素、荧光素和芘标记

  摘要：

  Synthese de nucleotides modates, de la cytidine et de l'uridine, permettant la liaison avec des composesfluores tel que la biotine, le pyrenebutyrate-1, la fluorescesine, afin de rendrefluorescence des oligonucleotides

  DOI：

  10.1021/ja00200a011
• 作为产物：
  描述：

  5-methoxycarbonylethyl-2'-deoxyuridine 在 吡啶 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 5'-Dimethoxytrityl-2'-deoxyuridine-5-<2-(N'-(trifluoroacetyl)amino)ethyl>propionamide
  参考文献：
  名称：

  Studies on the Two Thymine Residues in the Catalytic Core of 10-23 DNAzyme: The Impact on the Catalysis of Their 5-Substituted Functional Groups

  摘要：

  在 10-23 DNA 酶的 15 个聚合物催化核心中，每个残基对催化构象的贡献各不相同。在这里，非常保守的 T4 和最不保守的 T8 在其 5 位上被修饰为具有氢键能力的羟基、咪唑基和氨基。这些外部功能基团在催化核心内诱导了新的相互作用，从而对 10-23 DNA 酶的催化活性产生了消极和积极的影响，不同的连接方式可用于调节功能基团的作用。在核碱基水平上，T4 和 T8 的保守性可以得到认可，但在官能团水平上，T4 并不完全保守。可以对它们的 5-甲基基团进行修饰，以提高 DNA 酶的性能。

  DOI：

  10.3390/molecules22071011

文献信息

• 核苷类化合物或其盐、核酸及其应用
  申请人：中国人民解放军军事医学科学院毒物药物研 究所

  公开号：CN107236011B

  公开（公告）日：2020-11-27

  本发明属于生物医药领域，涉及一种核苷类化合物或其盐、核酸及其应用。具体地，本发明涉及式Ⅰ所示的核苷类化合物或其盐；在此基础上，本发明还涉及核酸。本发明的核酸可用作催化血管内皮生长因子受体2的mRNA裂解的脱氧核酶或者用作与人促红细胞生成素有亲和作用的适配体。
• TELSER, JOSHUA;CRUICKSHANK, KENNETH A.;MORRISON, LARRY E.;NETZEL, THOMAS +, J. AMER. CHEM. SOC., 111,(1989) N8, C. 6966-6976
  作者：TELSER, JOSHUA、CRUICKSHANK, KENNETH A.、MORRISON, LARRY E.、NETZEL, THOMAS +

  DOI：——

  日期：——