3-[[(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-[2,4-dioxo-5-(1-pyren-1-yltriazol-4-yl)pyrimidin-1-yl]oxolan-3-yl]oxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxypropanenitrile | 1241412-95-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 3-[[(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-[2,4-dioxo-5-(1-pyren-1-yltriazol-4-yl)pyrimidin-1-yl]oxolan-3-yl]oxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxypropanenitrile
• CAS: 1241412-95-2
• 化学式: C₅₇H₅₆N₇O₈P
• 分子量: 998.087
• InChiKey: RRDKFRRAELVNDQ-COZMOFATSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  9.5
• 重原子数：
  73
• 可旋转键数：
  19
• 环数：
  10.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.28
• 拓扑面积：
  163
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  12

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  C₄₈H₃₉N₅O₇ 、 2-氰乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 以73%的产率得到3-[[(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-[2,4-dioxo-5-(1-pyren-1-yltriazol-4-yl)pyrimidin-1-yl]oxolan-3-yl]oxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxypropanenitrile
  参考文献：
  名称：

  Pyrene-functionalized triazole-linked 2′-deoxyuridines—probes for discrimination of single nucleotide polymorphisms (SNPs)

  摘要：

  修饰有酞菁功能化的三唑连接2′-脱氧尿苷的寡核苷酸表现出显著的杂交诱导荧光发射增加，并通过G特异性猝灭实现有效的单核苷酸多态性（SNP）的荧光区分。

  DOI：

  10.1039/c0cc01133a

文献信息

• Pyrene-functionalized triazole-linked 2′-deoxyuridines—probes for discrimination of single nucleotide polymorphisms (SNPs)
  作者：Michael E. Østergaard、Dale C. Guenther、Pawan Kumar、Bharat Baral、Lee Deobald、Andrzej J. Paszczynski、Pawan K. Sharma、Patrick J. Hrdlicka

  DOI：10.1039/c0cc01133a

  日期：——

  Oligonucleotides modified with pyrene-functionalized triazole-linked 2′-deoxyuridines display remarkable hybridization-induced increases in fluorescence emission and enable efficient fluorescent discrimination of SNPs via G-specific quenching.

  修饰有酞菁功能化的三唑连接2′-脱氧尿苷的寡核苷酸表现出显著的杂交诱导荧光发射增加，并通过G特异性猝灭实现有效的单核苷酸多态性（SNP）的荧光区分。
• Synthesis and hybridization properties of oligonucleotides modified with 5-(1-aryl-1,2,3-triazol-4-yl)-2′-deoxyuridines
  作者：Mamta Kaura、Pawan Kumar、Patrick J. Hrdlicka

  DOI：10.1039/c2ob26717a

  日期：——

  Oligonucleotides modified with consecutive incorporations of 5-(1-aryl-1,2,3-triazol-4-yl)-2′-deoxyuridine monomers X–Z display strong thermal affinity and binding specificity toward RNA targets, due to formation of chromophore arrays in the major groove.

  连续掺入5-（1-芳基-1,2,3-三唑-4-基）-2'-脱氧尿苷单体X–Z修饰的寡核苷酸显示出很强的热亲和力和对RNA靶标的结合特异性，这是由于生色团的形成在主凹槽中排列。