2-((1E,3Z)-3-{1-[6-({6-[bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy]-5-[(3-carboxypropanoyl)oxy]hexyl}amino)-6-oxohexyl]-3,3-dimethyl-1,3-dihydro-2H-indol-2-ylidene}prop-1-en-1-yl)-1-ethyl-3,3-dimethyl-3H-indolium-5-sulfonate | 1186301-46-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 2-((1E,3Z)-3-{1-[6-({6-[bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy]-5-[(3-carboxypropanoyl)oxy]hexyl}amino)-6-oxohexyl]-3,3-dimethyl-1,3-dihydro-2H-indol-2-ylidene}prop-1-en-1-yl)-1-ethyl-3,3-dimethyl-3H-indolium-5-sulfonate
• CAS: 1186301-46-1
• 化学式: C₆₂H₇₃N₃O₁₁S
• 分子量: 1068.34
• InChiKey: BOPLNSFEWBPPKT-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  10.87
• 重原子数：
  77.0
• 可旋转键数：
  27.0
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.39
• 拓扑面积：
  183.84
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  11.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Rink amide resin 、 2-((1E,3Z)-3-{1-[6-({6-[bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy]-5-[(3-carboxypropanoyl)oxy]hexyl}amino)-6-oxohexyl]-3,3-dimethyl-1,3-dihydro-2H-indol-2-ylidene}prop-1-en-1-yl)-1-ethyl-3,3-dimethyl-3H-indolium-5-sulfonate 在 吡啶 、 三乙胺 、 N,N'-二异丙基碳二亚胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  New Indocyanine Derivatives for the Synthesis of Fluorescently Labeled Oligonucleotides

  摘要：

  新型磺化的Cy3和Cy5磷酸酰胺体以及固相支持物被合成。这些构建块用于合成末端或内部标签的寡脱氧核苷酸。对硫氰酸酯标记的寡核苷酸采用了温和的去保护方案。

  DOI：

  10.2174/157017809787003160
• 作为产物：
  描述：

  丁二酸酐 、 2-((1E,3Z)-3-{1-[6-({6-[bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy]-5-hydroxyhexyl}amino)-6-oxohexyl]-3,3-dimethyl-1,3-dihydro-2H-indol-2-ylidene}prop-1-en-1-yl)-1-ethyl-3,3-dimethyl-3H-indolium-5-sulfonate 在 4-二甲氨基吡啶 作用下， 以 吡啶 为溶剂， 反应 12.0h， 以90%的产率得到2-((1E,3Z)-3-{1-[6-({6-[bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy]-5-[(3-carboxypropanoyl)oxy]hexyl}amino)-6-oxohexyl]-3,3-dimethyl-1,3-dihydro-2H-indol-2-ylidene}prop-1-en-1-yl)-1-ethyl-3,3-dimethyl-3H-indolium-5-sulfonate
  参考文献：
  名称：

  New Indocyanine Derivatives for the Synthesis of Fluorescently Labeled Oligonucleotides

  摘要：

  新型磺化的Cy3和Cy5磷酸酰胺体以及固相支持物被合成。这些构建块用于合成末端或内部标签的寡脱氧核苷酸。对硫氰酸酯标记的寡核苷酸采用了温和的去保护方案。

  DOI：

  10.2174/157017809787003160