2-benzoyloxy-5-[2-[4-[2-[4-[2-[4-[2-[4-benzoyloxy-3-[N-[3-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxypropyl]-C-hydroxycarbonimidoyl]-5-(1,3-dioxan-2-yl)phenyl]ethynyl]phenyl]ethynyl]-2,5-didecoxyphenyl]ethynyl]phenyl]ethynyl]-N-[3-[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]propyl]-3-(1,3-dioxan-2-yl)benzenecarboximidic acid | 913814-98-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯丙烷和聚酮 - 缩酚酸和缩酚酸环醚类
• 英文名称: 2-benzoyloxy-5-[2-[4-[2-[4-[2-[4-[2-[4-benzoyloxy-3-[N-[3-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxypropyl]-C-hydroxycarbonimidoyl]-5-(1,3-dioxan-2-yl)phenyl]ethynyl]phenyl]ethynyl]-2,5-didecoxyphenyl]ethynyl]phenyl]ethynyl]-N-[3-[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]propyl]-3-(1,3-dioxan-2-yl)benzenecarboximidic acid
• CAS: 913814-98-9
• 化学式: C₁₁₈H₁₃₁N₄O₁₇P
• 分子量: 1908.33
• InChiKey: MRQQZRSYPNLTQD-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  27.1
• 重原子数：
  140
• 可旋转键数：
  59
• 环数：
  12.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  246
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  21

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-benzoyloxy-5-[2-[4-[2-[4-[2-[4-[2-[4-benzoyloxy-3-[N-[3-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxypropyl]-C-hydroxycarbonimidoyl]-5-(1,3-dioxan-2-yl)phenyl]ethynyl]phenyl]ethynyl]-2,5-didecoxyphenyl]ethynyl]phenyl]ethynyl]-N-[3-[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]propyl]-3-(1,3-dioxan-2-yl)benzenecarboximidic acid 以 ammonium hydroxide 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 [4-[2-[4-[2-[4-[2-[4-[2-[4-Benzoyloxy-3-[3-[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]propylcarbamoyl]-5-(1,3-dioxan-2-yl)phenyl]ethynyl]phenyl]ethynyl]-2,5-didecoxyphenyl]ethynyl]phenyl]ethynyl]-2-(1,3-dioxan-2-yl)-6-(3-hydroxypropylcarbamoyl)phenyl] benzoate
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of an elongated linear oligo(phenylene ethynylene)-based building block for application in DNA-programmed assembly

  摘要：

  描述了一种延长的线性寡核苷酸功能化模块（ELOM）的合成。ELOM结构基于一个取代有两个癸氧基团的寡（苯乙炔）骨架。其两个末端由作为化学交联剂的两个水杨醛部分构成。在被纳入到寡核苷酸序列之前，该模块的有机部分，即延长的线性模块（ELM），被功能化为含有二甲氧基三苯甲基基团和磷酰胺基团的形式。这使得它能够通过自动化的DNA合成过程被插入到30碱基长的寡核苷酸序列的中间。获得的ELOMs通过聚丙烯酰胺凝胶电泳和MALDI-TOF质谱分析进行了表征。参照先前报道的LOM和TOM结构，测试了ELOM模块的偶联反应。

  DOI：

  10.1039/b605844b
• 作为产物：
  描述：

  [4-[2-[4-[2-[4-[2-[4-[2-[4-Benzoyloxy-3-[3-[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]propylcarbamoyl]-5-(1,3-dioxan-2-yl)phenyl]ethynyl]phenyl]ethynyl]-2,5-didecoxyphenyl]ethynyl]phenyl]ethynyl]-2-(1,3-dioxan-2-yl)-6-(3-hydroxypropylcarbamoyl)phenyl] benzoate 、 2-氰乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.0h， 以100%的产率得到2-benzoyloxy-5-[2-[4-[2-[4-[2-[4-[2-[4-benzoyloxy-3-[N-[3-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxypropyl]-C-hydroxycarbonimidoyl]-5-(1,3-dioxan-2-yl)phenyl]ethynyl]phenyl]ethynyl]-2,5-didecoxyphenyl]ethynyl]phenyl]ethynyl]-N-[3-[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]propyl]-3-(1,3-dioxan-2-yl)benzenecarboximidic acid
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of an elongated linear oligo(phenylene ethynylene)-based building block for application in DNA-programmed assembly

  摘要：

  描述了一种延长的线性寡核苷酸功能化模块（ELOM）的合成。ELOM结构基于一个取代有两个癸氧基团的寡（苯乙炔）骨架。其两个末端由作为化学交联剂的两个水杨醛部分构成。在被纳入到寡核苷酸序列之前，该模块的有机部分，即延长的线性模块（ELM），被功能化为含有二甲氧基三苯甲基基团和磷酰胺基团的形式。这使得它能够通过自动化的DNA合成过程被插入到30碱基长的寡核苷酸序列的中间。获得的ELOMs通过聚丙烯酰胺凝胶电泳和MALDI-TOF质谱分析进行了表征。参照先前报道的LOM和TOM结构，测试了ELOM模块的偶联反应。

  DOI：

  10.1039/b605844b

文献信息

• Synthesis of an elongated linear oligo(phenylene ethynylene)-based building block for application in DNA-programmed assembly
  作者：Peter Blakskjær、Kurt V. Gothelf

  DOI：10.1039/b605844b

  日期：——

  The synthesis of an elongated linear oligonucleotide-functionalised module (ELOM) is described. The ELOM structure is based on an oligo(phenylene ethynylene) backbone substituted with two decyloxy groups. The two termini constitute two salicylaldehyde moieties acting as chemical cross-linkers. Before incorporation into an oligonucleotide sequence the organic part of the module, the elongated linear module (ELM), is functionalised with a dimethoxytrityl group and a phosphoramidite group. This enables incorporation into the middle of 30-mer oligonucleotide sequences by automated DNA synthesis. The obtained ELOMs were characterised by polyacrylamide gel electrophoresis and MALDI-TOF mass spectrometry. In analogy with previously reported LOM and TOM structures the coupling reactions of the ELOM modules were tested.

  描述了一种延长的线性寡核苷酸功能化模块（ELOM）的合成。ELOM结构基于一个取代有两个癸氧基团的寡（苯乙炔）骨架。其两个末端由作为化学交联剂的两个水杨醛部分构成。在被纳入到寡核苷酸序列之前，该模块的有机部分，即延长的线性模块（ELM），被功能化为含有二甲氧基三苯甲基基团和磷酰胺基团的形式。这使得它能够通过自动化的DNA合成过程被插入到30碱基长的寡核苷酸序列的中间。获得的ELOMs通过聚丙烯酰胺凝胶电泳和MALDI-TOF质谱分析进行了表征。参照先前报道的LOM和TOM结构，测试了ELOM模块的偶联反应。