| 1616784-19-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• CAS: 1616784-19-0
• 化学式: C₆₅H₉₄N₇O₁₄PSi₂
• 分子量: 1284.64
• InChiKey: VXMKDBYDGSTKBY-OJDANEDNSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  10.61
• 重原子数：
  89.0
• 可旋转键数：
  30.0
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.57
• 拓扑面积：
  248.92
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  18.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  、 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 7.0h， 以71%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  酰胺是磷酸核苷间键的极佳模拟物，并且在短干扰 RNA 中具有良好的耐受性。

  摘要：

  RNA 干扰 (RNAi) 已成为功能基因组学的重要工具，并具有令人着迷的治疗潜力。然而，目前的短干扰 RNA (siRNA) 设计对于体内应用来说并不是最佳的。非离子磷酸盐主链修饰可能具有改善 siRNA 特性的潜力，但在 RNAi 技术中很少得到探索。使用 X 射线晶体学和 RNAi 活性测定，本研究表明 3'-CH2-CO-NH-5' 酰胺是 RNA 中磷酸二酯核苷间键的极好替代品。晶体结构显示酰胺修饰的RNA形成典型的A型双链体。酰胺羰基指向主沟并呈现类似于磷酸键中的 P-OP2 键的方向。酰胺键通过连接羰基和相邻磷酸氧的串联水充分水合。酰胺在 siRNA 的引导链和过客链的内部位置均具有耐受性，当放置在过客链 5' 端附近时，可能会增加沉默活性。因此，含有八个酰胺键的 siRNA 比未修饰的对照活性更高。结果表明，RNAi 可以耐受更广泛的酰胺修饰，这可能有助于优化体内应用的 siRNA。

  DOI：

  10.1093/nar/gku235